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[GROMACS] 模拟nvt过程中,所设的截断值发生改变

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老师们,我模拟li在聚合物固态电解质传输体系,含有18880个原子,然后盒子大小24*24*24,在能量最小化过程结束后,进行nvt弛豫,截断值在nvt.mdp我设置的是1.2nm,但刚开始模拟就出现图中情况,截断半径成为1.875nm,想问问我哪方面设置不太合理?

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nvt (2).mdp

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发表于 Post on 2025-7-27 05:03:02 | 只看该作者 Only view this author
mdrun命令有一个选项tunepme,会自动优化傅立叶变换格点数和截断半径来平衡负载,具体的可以看看手册
-[no]tunepme (yes)
Optimize PME load between PP/PME ranks or GPU/CPU

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发表于 Post on 2025-7-28 01:16:20 | 只看该作者 Only view this author
没有什么不合适的。gromacs自动给你改成了计算效率最高的cutoff,这不会影响静电作用的计算精度
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