计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 708|回复 Reply: 11
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 求助:cp2k2024.1优化Ni表面结构时,几何优化不收敛

[复制链接 Copy URL]

34

帖子

0

威望

745

eV
积分
779

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 ldwf 于 2025-8-31 15:31 编辑

参数设置方面:pbesol;d3(bj);550 cut off; 磁矩0.5; 开启smearing;固定底3层原子;
目前状态scf收敛很快;但是8-9步离子步后128g内存就满了,继算后运行了30步,能量可以达到收敛标准,其余不能达到收敛标准;
请问对于输入文件的参数设置的是否正确? 还有续算的必要么?如果参数或模型有问题,在36核,128g条件下,考虑效率的话该怎么调整呢?



Ni-.inp

11.22 KB, 下载次数 Times of downloads: 10

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125122

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2025-8-28 04:00:53 | 只看该作者 Only view this author
当前计算没有意义,晶胞不大,而k点都没有考虑
随着优化进行内存占用量不断提高,是内存泄漏所致。说明编译安装过程存在问题。正常情况不会如此
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

34

帖子

0

威望

745

eV
积分
779

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-28 08:50:33 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ldwf 于 2025-8-28 08:56 编辑
sobereva 发表于 2025-8-28 04:00
当前计算没有意义,晶胞不大,而k点都没有考虑
随着优化进行内存占用量不断提高,是内存泄漏所致。说明编 ...

感谢社长,我将两个镍重新优化后切面四层,同时将pbesol更换为pbe,运算正常结束了。20个离子步而且没出现内存满的情况。
关于k点问题有个请教,是根据晶胞x与y的长度乘以k点数达到某一数值来设置k点么?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125122

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2025-8-28 11:33:22 | 只看该作者 Only view this author
ldwf 发表于 2025-8-28 08:50
感谢社长,我将两个镍重新优化后切面四层,同时将pbesol更换为pbe,运算正常结束了。20个离子步而且没出 ...

你若懒得做k点收敛性测试就这么粗略判断
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

1239

帖子

6

威望

2537

eV
积分
3896

Level 5 (御坂)

傻傻的木瓜

5#
发表于 Post on 2025-8-28 13:25:37 | 只看该作者 Only view this author
在一楼的Ni.inp里,为啥上面三层的六方密堆积面垂直于z轴,但下面三层的Ni的六方密堆积面垂直于x轴,这是什么异质结吗?

在按上述提醒加了k点后能成功SCF收敛、几何优化收敛的话,我觉得可以把所有输入输出文件打包上传作为帖子附件分享,毕竟正如这帖的讨论那样,其他很多拿CP2K算磁性表面体系的用户都想看到一个能工作的例子。
√546=23.36664289109

34

帖子

0

威望

745

eV
积分
779

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-28 13:39:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ldwf 于 2025-8-29 14:56 编辑
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-8-28 13:25
在一楼的Ni.inp里,为啥上面三层的六方密堆积面垂直于z轴,但下面三层的Ni的六方密堆积面垂直于x轴,这是什 ...

上三层是立方的,下三层是六方的。上述结构的上三层和下三层是由qe优化得到的。
在用cp2k优化异质结构时,最初scf不收敛,改动温度设置,scf收敛顺利。
后续用cp2k将两个Ni晶胞重新优化并分别切四层面后优化,重新组成异质结,但是更改pbesol为pbe,算力有限同时不考虑精度所以仍然没有设置k点,运算正常结束。
但是我觉得不是更改pbe的原因,因为我试过pbe同样是上述结构时问题没有解决,同样是scf收敛,力不收敛。改为四层时问题解决。

19

帖子

0

威望

859

eV
积分
878

Level 4 (黑子)

7#
发表于 Post on 2025-8-31 01:42:12 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-8-28 13:25
在一楼的Ni.inp里,为啥上面三层的六方密堆积面垂直于z轴,但下面三层的Ni的六方密堆积面垂直于x轴,这是什 ...

请问下为什么没看到输入文件,能看到这个体系磁性表面的计算案例

1239

帖子

6

威望

2537

eV
积分
3896

Level 5 (御坂)

傻傻的木瓜

8#
发表于 Post on 2025-8-31 08:42:53 | 只看该作者 Only view this author
zzp 发表于 2025-8-31 01:42
请问下为什么没看到输入文件,能看到这个体系磁性表面的计算案例

应该是楼主昨天自己编辑帖子删掉了,但是就算还留着也不存在参考价值,没看到楼上的说法吗?通过不合理设置(明显一点的如开IGNORE_CONVERGENCE_FAILURE忽略收敛失败、调大EPS_SCF收敛限,稍微隐藏一点的如该用k点却没用、该用对角化却用OT算法、该设置原子初猜磁矩却没设等等)获得的收敛不值得学习借鉴。
√546=23.36664289109

34

帖子

0

威望

745

eV
积分
779

Level 4 (黑子)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-31 15:36:57 | 只看该作者 Only view this author
zzp 发表于 2025-8-31 01:42
请问下为什么没看到输入文件,能看到这个体系磁性表面的计算案例

重新上传了修改后的文件,但是没有k点,运行正常,如果你有条件可以加k点试试。

34

帖子

0

威望

745

eV
积分
779

Level 4 (黑子)

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-31 15:50:52 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-8-31 08:42
应该是楼主昨天自己编辑帖子删掉了,但是就算还留着也不存在参考价值,没看到楼上的说法吗?通过不合理设 ...

因为我是搞实验的,对于理论方面的原理不太懂,就是会一点基本操作,但是看过这些例子,也大体知道哪些关键词以及参数是必须的。偶然改动温度scf收敛。实验室工作环境只有双路2696v3,加了k点太慢。也希望有条件的社友看一下加k点能否收敛。

19

帖子

0

威望

859

eV
积分
878

Level 4 (黑子)

11#
发表于 Post on 2025-8-31 16:02:14 | 只看该作者 Only view this author
ldwf 发表于 2025-8-31 15:50
因为我是搞实验的,对于理论方面的原理不太懂,就是会一点基本操作,但是看过这些例子,也大体知道哪些关 ...

感觉这个输入文件估计电子步需要很多步数才能收敛,温度6000K是不是太高了

34

帖子

0

威望

745

eV
积分
779

Level 4 (黑子)

12#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-31 16:04:14 | 只看该作者 Only view this author
zzp 发表于 2025-8-31 16:02
感觉这个输入文件估计电子步需要很多步数才能收敛,温度6000K是不是太高了

我也不知道是否合理。可以问问专业的社友。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-18 00:09 , Processed in 0.173441 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list