计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 269|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] opt=readopt冻结原子优化失败

[复制链接 Copy URL]

255

帖子

0

威望

832

eV
积分
1087

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师:
      我按照帖子http://bbs.keinsci.com/thread-9022-1-1.html,中讲的,冻结了部分原子优化,输入文件如下:
    %chk=Au11.chk
%nproc=16
%mem=60GB
# opt=readopt blyp genecp  SCRF=(PCM,Solvent=Acetonitrile)

Au11-cluster

3 1
Au                 9.77986084   11.12905299    7.76181044
Au                10.00547431   10.59981187   10.21203617
Au                 9.15261962   12.90117902    9.70753372
Au                11.74171098   12.20232157    9.43037118
Au                11.66227505    9.47253661    8.77788352
Au                 9.07147758    8.66101460    9.04767320
Au                12.27761408   10.35859962   11.32287991
Au                10.37578264   12.14394804   12.05256930
Au                 7.57253316   10.78703775    9.60047497
Au                 8.50281300   10.12329785   12.07379419
Au                10.47528574    8.42242246   11.35948015
P                  9.40914629   12.10243256    5.89483251
P                  8.35521369   14.76606492    9.04306263
P                 13.50364093   13.23996483    8.86032546
。。。。。。。。。。。此处太长省略
。。。。。。。。。。
H                 12.90567990    7.62444442   10.97016636

notatoms=C,H

Au 0
Lanl2DZ
****
P C H   0
STO-3G
****

Au 0
Lanl2DZ

我的目的是冻结前面所有的Au原子,结果发现优化过程中Au-Au的键长发生了轻微的变化,比如:Au(1-4)=2.79Anstong,优化了六步以后成了2.84Anstong,是这个方法有Bug吗?还是我输入上有错。我用这个基组是因为团簇太大做最初步的优化,各位老师勿喷

255

帖子

0

威望

832

eV
积分
1087

Level 4 (黑子)

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-30 22:38:34 | 只看该作者 Only view this author
用第一种方法冻结没有原子移动的问题,直接在原子符号后面添加-1

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125127

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2025-8-31 07:58:20 | 只看该作者 Only view this author
BLYP描述当前体系非常不适合。哪怕PBE都是更好的选择
STO-3G预优化毫无意义,对P连d极化都没有,结果一塌糊涂。预优化也至少得选个结果还能看得过去的,要不然还不如不预优化
notatoms=C,H冻结的是C和H,和你的目的完全相反

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

255

帖子

0

威望

832

eV
积分
1087

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-1 10:18:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-8-31 07:58
BLYP描述当前体系非常不适合。哪怕PBE都是更好的选择
STO-3G预优化毫无意义,对P连d极化都没有,结果一塌 ...

,非常感谢Sob老师,是我太矬了

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-19 07:06 , Processed in 0.161472 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list