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[GROMACS] 求助:关于计算rdf选区片段的疑问

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请问文献中这种分子片段的质心之间的rdf如何计算呢?我能选取整个分子的质心,但是像这种不同片段的质心的选择语句和索引文件应该如何构建呢?

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发表于 Post on 2025-10-9 14:14:51 | 只看该作者 Only view this author
试图利用原子名作为选择语句选择分子中的特定片段。moleculetype里每个原子的原子名都是唯一的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-9 18:31:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-9 14:14
试图利用原子名作为选择语句选择分子中的特定片段。moleculetype里每个原子的原子名都是唯一的

卢老师,就是用片段的某个具体原子来近似代替局部片段的质心是吗

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发表于 Post on 2026-1-15 14:59:38 | 只看该作者 Only view this author
我有同样的疑问,请问现在问题解决了吗?

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