求助，PEG和残基ALA的连接拓扑怎么拼接回原来的蛋白质拓扑中

yangguofeng · 发表于 Post on 2025-10-15 17:08:09

求助一下大家，因为peg和蛋白质的结构太大，我将他们需要连接的片段截取出来使用高斯view进行手动的连接，建键。然后进行高斯优化，现在高斯优化已经完成了。我应该怎么将他们拼回去啊。

student0618 · 发表于 Post on 2025-10-15 18:44:03

如果top itp中残基名、原子名、原子序号和本来的gro一致就可以直接用。

yangguofeng · 发表于 Post on 2025-10-15 19:59:23

student0618 发表于 2025-10-15 18:44
如果top itp中残基名、原子名、原子序号和本来的gro一致就可以直接用。

不一样，我在进行拼接的时候对拼接的原子进行了删氢操作，而且高斯优化后，它将其转为了一个整体。

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[综合交流] 求助，PEG和残基ALA的连接拓扑怎么拼接回原来的蛋白质拓扑中