如何判断MS的Forcite模块优化后的晶胞结构的合理性？

Sonnenblumen · 发表于 Post on 2025-10-21 15:34:27

各位老师好！我想通过MS的Forcite模块计算聚对苯乙烯磺酸吸附水分子的吸附能。前期计算了聚对苯乙烯磺酸单体吸附不同个数水分子的情况，但是考虑到反应过程中聚合物分子内可能存在质子传递的情况，单一考虑单体情况不太具有说服力。于是通过MS构建聚对苯乙烯磺酸的周期性结构，以二聚体作为材料的重复单元。为避免镜像结构的影响，初始构建的晶胞结构如附件1所示，但是通过Forcite模块优化后，其晶胞偏离了原始的正交结构（优化后的结构如附件2所示），请问这是否合理？由于是MS新手，诸多问题还没太搞清楚，不太确定这样操作的合理性和可行性，后续想计算不同个数水分子在材料表面的吸附能，那添加水分子时是要在该优化好的晶胞的基础上继续计算，还是添加水分子后再次重新优化晶胞和分子的整体结构呢？恳请各位老师批评指正！谢谢各位老师！

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