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[GROMACS] 求助:Gromacs利用自由能微扰计算溶解自由能时,结果中出现异常大的值(10e29数量级)

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各位老师,我目前在做纤维素晶体中角落链在水中的溶解自由能计算,利用自由能微扰(FEP)的方式,gmx bar计算的结果出现异常值,请问我该如何解决?如果有想交流可以联系我:842655799@qq.com

纤维素模型是以8糖为基础构建的周期性无限长链,图1为生产模拟的mdp文件,图2为gmx bar的结果(异常值已标记),lambda如下(共20个)
                              00   01   02   03    04    05    06    07    08    09   10   11    12    13   14   15    16    17    18    19
FEP_LAMBDAS  = (0.00 0.05 0.10 0.20 0.30 0.40 0.50 0.60 0.70 0.80 0.85 0.90 0.92 0.94 0.95 0.96 0.97 0.98 0.99 1.00)
VDW_LAMBDAS  = (0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 0.20 0.30 0.40 0.50 0.60 0.68 0.75 0.82 0.88 0.94 1.00)
COUL_LAMBDAS = (0.00 0.05 0.10 0.20 0.30 0.40 0.50 0.60 0.70 0.80 0.85 0.90 0.92 0.94 0.95 0.96 0.97 0.98 0.99 1.00)


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图1 用于生产模拟的mdp文件

图1 用于生产模拟的mdp文件

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图2 FEP结果存在异常值

图2 FEP结果存在异常值

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