求助：用VMD和Multiwfn分别看分子轨道，VMD显示不全

Baivkup · 发表于 Post on 2025-10-23 17:12:27

本帖最后由 Baivkup 于 2025-10-23 17:24 编辑

同一分子同一轨道，为什么VMD显示的缺一块，Multiwfn生成cube选的也是高质量格点

二编：好像发错分区了...对不起

lemon_electron · 发表于 Post on 2025-10-23 20:32:23

VMD里调一下你蓝色等值面对应相位的isosurface

〇66 · 发表于 Post on 2025-10-23 23:37:17

等值面会等比例缩放，太小的时候是不会显示的，你可以在这里调整成为满意的以后，然后再VMD里输入命令 iso+空格+等值面的数值，就是在你发的multiwfn截图里右下角Isovalue那个地方里对应的同样的值，这样就统一了

SharkYYX2025 · 发表于 Post on 2025-10-24 00:43:57

如果在VMD的图形窗口手动调节，可能只改了第一个isosurface。可以按照此贴的脚本同时调整cub文件所有轨道的等值面
在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法 http://sobereva.com/483

但我看你这个不像是等值面数值没调整，像是导出的cub不完整。因为左下部分蓝色等值面看起来很饱满。可以重新导出cub，在没导出结束之前不要关闭Multiwfn

Baivkup · 发表于 Post on 2025-10-24 15:23:06

SharkYYX2025 发表于 2025-10-24 00:43
如果在VMD的图形窗口手动调节，可能只改了第一个isosurface。可以按照此贴的脚本同时调整cub文件所有轨道的 ...

两个isosurface都改了，我尝试一个轨道导出一个cube文件以后就显示正常了，上面不正常的是批量轨道导出到一个cube文件。。应该就是cube文件的问题

Baivkup · 发表于 Post on 2025-10-24 15:23:57

lemon_electron 发表于 2025-10-23 20:32
VMD里调一下你蓝色等值面对应相位的isosurface

是对应的，一个是0.02，另一个是-0.02

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[建模与可视化] 求助：用VMD和Multiwfn分别看分子轨道，VMD显示不全

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