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[辅助/分析程序] Shermo使用:单设定温度与扫描温度得到的自由能不一致的问题(原因已找到)

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本帖最后由 saaamon 于 2025-11-9 10:05 编辑

参照sob的博文(使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元)计算有机分子(富勒烯C60)的自由能遇到如下问题:

1.首先,使用orca,在B3LYP-D3/GCP(DFT/SVP) def2-SVP下对分子进行opt和freq计算(真空),得到频率计算后的.out文件, 并通过wB97M-V/GCP(DFT/TZ) def2-TZVP(SMD 甲苯)计算精确的单点能量,使用shermo计算298.15K,1atm标准条件下相应的自由能,
将settings.ini参数修改如下:

E= -2286.45450289399  
prtvib= 0  
T= 298.15  
P= 1.0  
sclZPE= 0.985 (没有相关的校正因子,使用B3LYP/def2-TZVP的ZPE校正因子代替
sclheat= 1.0  
sclS= 1.0  
sclCV= 1.0
ilowfreq= 2

得到的298.15K下的自由能数据:Sum of electronic energy and thermal correction to G:       -2286.1236553 a.u.

2.随后,尝试使用shermo进行温度扫描,
settings.ini参数修改如下:

E= -2286.45450289399  
prtvib= 0  
T= 273.15,373.15,2.5  (扫描其中会包含温度298.15)
P= 1.0  
sclZPE= 0.985
sclheat= 1.0  
sclS= 1.0  
sclCV= 1.0
ilowfreq= 2

得到部分数据如下:
......
T(K)             G
295.65     -2286.06322
298.15   -2286.06276(扫描中298.15K的自由能数值与上面得到的-2286.1236553不一致,差了约0.06 a.u.,这个差值有点大
300.65     -2286.06229
......
这是我哪里的设置或者计算出了问题么?请大神赐教,不胜感激。



------
已经找到原因(一定要用正规的文本软件),如图:还是希望以上的内容能给初学者带来一点启示,另外强烈推荐使用shermo来计算各种热力学数据

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发表于 Post on 2025-11-9 00:11:59 | 只看该作者 Only view this author
我没发现这种问题。把两次settings.ini都上传,载入Shermo的文件也压缩后上传
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