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[GROMACS] 相互作用能计算结果是正的,和模拟快照不相符

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本帖最后由 xjp1127721434 于 2025-11-25 16:17 编辑

计算的是A分子自组装过程,在盒子里面放了10个A分子,经过10ns的模拟,分子组装到了一起,但是用rerun命令计算coul-SR和LJ-SR相互作用能发现A-A之间的静电相互作用很正,求教是为什么。

202511251609219152..png (8.24 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

初态

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相互作用能

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发表于 Post on 2025-11-26 06:30:12 | 只看该作者 Only view this author
参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/KGMX)这页幻灯片说的:

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-29 15:01:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-11-26 06:30
参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/KGMX)这页幻灯片说的:

谢谢sob老师

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