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[Multiwfn使用咨询] 求助,NAdO分析时内存不够

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本帖最后由 计算消白 于 2025-11-25 23:26 编辑

用windows工作站先结构优化并计算了单点能,得到了.molden文件,将molden文件导入Multiwfn做NAdO分析(参考http://sobereva.com/719的2.3部分,社长的案例我试过了,在工作站上可以正常运行)。我用的命令窗口,发现问题好像是内存不够(如下图),如何解决这个问题?molden文件太大了没法上传。我上传了计算单点能的输入文件。

体系:slab是Zn(256个原子),表面吸附一个COOH。
电脑配置:cpu 8375C 64核 内存128G。

Zn882COOH1energy.inp

17.55 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

单点能计算文件

settings.ini

20.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

Multiwfn配置文件

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发表于 Post on 2025-11-26 02:09:22 | 只看该作者 Only view this author
找个内存大的机子在Linux下算,或者尝试把晶胞弄小点
还一个可尝试的办法是先用Multiwfn主功能6里的38 Make orbital occupations integer and satisfy Aufbau principle,让轨道占据数都重排成整数(单行列式波函数),然后再做NAdO分析,这样计算AOM的时候就不需要考虑空轨道了,能大幅节约内存
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-3 17:42:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 计算消白 于 2025-12-3 17:45 编辑

谢谢站长!我把体系缩小了,现在可以得到FOM,但在做BOD和NAdO分析时,出现一下错误:
Error: Only restricted and unresticted single determinant wavefunction are supported!
我把 http://sobereva.com/719 的Pd(100)表面吸附苯案例跑完了,没出现这个问题。
我修改了波函数,按照轨道能量由低到高重排占据数,还是不行。
我把吸附构型(.cif)和单点能计算文件上传了。

Zn_COOH_energy_smear.inp

11.35 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

单点能计算文件

Zn_COOH_opt-1.cif

7.84 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

吸附构型

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发表于 Post on 2025-12-4 11:05:10 | 只看该作者 Only view this author
计算消白 发表于 2025-12-3 17:42
谢谢站长!我把体系缩小了,现在可以得到FOM,但在做BOD和NAdO分析时,出现一下错误:
Error: Only restri ...

Multiwfn里重排轨道占据数后没理由出现此问题。本身此体系的类型和Pd(100)表面吸附苯没有本质区别
至少不通过网盘给出压缩后的molden文件我没法测试
如果不点我帖子下方回复按钮进行回复,99%概率我看不到
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-4 13:11:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-4 11:05
Multiwfn里重排轨道占据数后没理由出现此问题。本身此体系的类型和Pd(100)表面吸附苯没有本质区别
至少 ...

谢谢站长!我把 压缩后的 .molden 文件用网盘上传了:
通过网盘分享的文件:Zn_COOH_energy_smear-MOS-1_0.7z
链接: https://pan.baidu.com/s/1-Vvf0XTXgCeYcm5XIa__Iw 提取码: p89s
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发表于 Post on 2025-12-4 15:32:27 | 只看该作者 Only view this author
计算消白 发表于 2025-12-4 13:11
谢谢站长!我把 压缩后的 .molden 文件用网盘上传了:
通过网盘分享的文件:Zn_COOH_energy_smear-MOS-1 ...

&SMEAR里加上FIXED_MAGNETIC_MOMENT 1让alpha和beta电子数差值保持为1可解决
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-4 17:19:25 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 计算消白 于 2025-12-4 17:22 编辑
sobereva 发表于 2025-12-4 15:32
&SMEAR里加上FIXED_MAGNETIC_MOMENT 1让alpha和beta电子数差值保持为1可解决

1. 谢谢社长!在&SMEAR里加上FIXED_MAGNETIC_MOMENT 1后,上述问题解决了。
2. 得到 .molden文件后,我在用FOM做NAdO分析时,按照http://sobereva.com/719 Pd(100)表面吸附苯的步骤:设置片段1为COOH,片段2为和C相连的Zn(编号84),发现Zn表面吸附COOH后,1号NAdO轨道成分主要由Zn和C的s和p轨道贡献,Zn的d轨道贡献很小。感觉结果不太对?Zn的d轨道怎么贡献这么小?

我把吸附构型、1号NAdO轨道、轨道成分的截图放上了。

吸附构型.jpg (73.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

吸附构型

吸附构型

1号NAdO轨道.jpg (94.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

1号NAdO轨道

1号NAdO轨道

1号NAdO轨道的成分.jpg (208.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

1号NAdO轨道的成分

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发表于 Post on 2025-12-4 21:55:23 | 只看该作者 Only view this author
计算消白 发表于 2025-12-4 17:19
1. 谢谢社长!在&SMEAR里加上FIXED_MAGNETIC_MOMENT 1后,上述问题解决了。
2. 得到 .molden文件后,我 ...

本来Zn就是d壳层满占据,和Pd的成键明显不同
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