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[新手求助] 复合物结合能计算问题求助

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各位老师好,我计算了化合物A分别与20种不同的化合物B形成的AB复合物的结合自由能(ΔGbind),结合能(ΔEbind)以及相互作用能(ΔEint),其中ΔGbind和ΔEbind是添加了隐式溶剂模型计算出来的,而ΔEint是用sobEDA方法算出来的,没有考虑变形能以及溶剂效应。计算出来的结果显示,20种复合物的ΔGbind,ΔEbind以及ΔEint三个参数趋势不一致,比如复合物1有最负的ΔEbind,但是复合物1对应的ΔEint缺不是最负,请问这是正常的吗,这样的数据可以拿来用吗以及放在文章里比较。

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发表于 Post on 2025-12-5 11:56:30 | 只看该作者 Only view this author
手动计算相互作用能,确保sobEDA给你的和手算的一致
并且自己算变形能、溶解自由能,弄清楚这俩因素怎么影响结合,参考下文的讨论
谈谈分子间结合能的构成以及分解分析思想
http://sobereva.com/733http://bbs.keinsci.com/thread-50890-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-5 13:31:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-5 11:56
手动计算相互作用能,确保sobEDA给你的和手算的一致
并且自己算变形能、溶解自由能,弄清楚这俩因素怎么影 ...

谢谢老师指导

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-8 17:30:33 | 只看该作者 Only view this author

老师,还想请教一下变形能应该怎么算。

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