xTB调用ORCA进行几何优化时使用多核心会报错（似乎已解决）

Voidmio · 发表于 Post on 2025-12-7 21:12:41

本帖最后由 Voidmio 于 2025-12-8 00:30 编辑

今使用xTB调用orca进行联合几何优化，使用命令为：/.../xtb coord --opt tight --orca -I opt.inp |tee opt-part2.out
其中 opt.inp 内容为：

opt.inp (181 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0)

inp 内容为：

inp (251 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0)

可见我在 inp 中规定了 nprocs 1, 这时上述命令是可以正确结束的（输出内容见 opt-part2.out1.txt），可见 xTB 对 ORCA 每轮的单点结果进行了校验，并最终收敛：

opt-part2.out1.txt (429.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

但如果我把这个 nprocs 1 改为 nprocs 32（不是因为太多，2 核心也是相同的报错），就会在第一次 ORCA 任务结束后的校验时，xTB报错（输出内容见 opt-part2.out32.txt）：

opt-part2.out32.txt (47.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

（这是 nprocs 32 的输出末尾）

可见这里第一轮 ORCA 是正确结束的，其不存在 omp 的调度问题（多核心单独运行 ORCA 也可以正确结束）；反倒是似乎无关的 xTB 报错了。并且这里nprocs 32第一轮ORCA的输出和nprocs 1应该是完全相同的：

（这是 nprocs 1 的第一次 ORCA 结束，可见 ORCA TERMINATED NORMALLY 后就回到 xTB 了）

环境里写有
export OMP_NUM_THREADS=64
export MKL_NUM_THREADS=64
export OMP_STACKSIZE=4G

均没有改动。单独运行 ORCA 和 xTB 应该都没问题，ORCA、OpenMPI、xTB 的版本分别是5.0.1，4.1.1，6.7.1（前两者也试过6.1.0、4.1.6，没区别）

求教各位老师，这是怎么回事呢

niobium · 发表于 Post on 2025-12-7 21:28:18

直接在orca 6.1中用! opt freq xtb2就行了。ORCA 6.1中已经内置了xtb。

Voidmio · 发表于 Post on 2025-12-7 21:56:08

niobium 发表于 2025-12-7 21:28
直接在orca 6.1中用! opt freq xtb2就行了。ORCA 6.1中已经内置了xtb。

不中啊，我这个是grimme小玩具中的一环，后续还有程序要读取这次xtb的输出内容，非常头大

Voidmio · 发表于 Post on 2025-12-8 00:32:23

现在看来，应该是ompi使用btl时候会莫名其妙warning，其实没报错但给xtb干懵了。
不是我喜欢的字节传输层，直接禁用：export OMPI_MCA_btl=^openib
这样就可以run了，但是不知道有没有什么坏处

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