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[GROMACS] 求助:在将能量极小化的方法从cg改为sd之后报错

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楼主
在进行能量极小化的时候,一开始用的是CG方法,出现报错

The coordinates could not be constrained. Minimizer 'cg' can not handleconstraint failures, use minimizer 'steep' before using 'cg'.

后来将能量极小值方法改为sd之后发现整体系统不在T-Coupling groups中了

7335 atoms are not part of any of the T-Coupling groups



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发表于 Post on 2025-12-13 22:19:59 | 只看该作者 Only view this author
sd、cg算法的选择是能量极小化过程的事,控温是MD过程的事。不要胡乱关联
GROMACS要求在使用控温时,每个原子都要在一个控温组里。该怎么定义怎么定义
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-18 01:26:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-13 22:19
sd、cg算法的选择是能量极小化过程的事,控温是MD过程的事。不要胡乱关联
GROMACS要求在使用控温时,每个 ...

好的,感谢老师解惑

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