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楼主 Author: qiongxie
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[新手求助] NRT看不到结果

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-5 16:13:07 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 qiongxie 于 2017-6-5 16:25 编辑
sobereva 发表于 2017-6-1 18:35
NBO6手册里搜NRTSTR

老师,我按照手册里先预先设定了一种可能结构,可是还是算不出来?
$nbo nrt  $end
$NRTSTR
  STR
    LONE 18 1 19 1 END
    BOND D 1 2 S 1 6 S 1 18 S 2 3 S 2 8 S 3 4 S 3 9 D 4 5 S 4 10 S 5 6 S 5 11
        S 1 2 D 2 3 S 3 4 D 4 5 S 5 6 D 1 6 D 3 9 S 9 13 D 13 12 S 12 10 D 10 4
        S 2 8 S 7 9 S 13 16 S 12 15 S 10 14 S 5 11 S 1 18 S 6 17 S 18 19 D 17 19
        S 18 24 S 17 20 S 20 21 S 20 22 S 20 23 S 24 25 S 24 26 S 24 27
  END  END
$END
又出现如下提示: Structure 1 of the $NRTSTR keylist has 1 too many electron pair(s)是因为预设的结构不合理么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-16 15:47:42 | 只看该作者 Only view this author
$NRTSTR
  STR
    LONE 18 1 19 1 END
    BOND D 1 2 S 1 6 S 1 18 S 2 3 S 2 8 S 3 4 S 3 9 D 4 5 S 4 10 S 5 6 S 5 11
        S 1 2 D 2 3 S 3 4 D 4 5 S 5 6 D 1 6 D 3 9 S 9 13 D 13 12 S 12 10 D 10 4
        S 2 8 S 7 9 S 13 16 S 12 15 S 10 14 S 5 11 S 1 18 S 6 17 S 18 19 D 17 19
        S 18 24 S 17 20 S 20 21 S 20 22 S 20 23 S 24 25 S 24 26 S 24 27
  END
  END
$END
老师,我设置了上述的可能性,但是出现如下结果该如何解决呢?
Structure 1 of the $NRTSTR keylist has 2 too few electron pair(s)

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发表于 Post on 2017-6-17 17:10:04 | 只看该作者 Only view this author
qiongxie 发表于 2017-6-16 15:47
$NRTSTR
  STR
    LONE 18 1 19 1 END

不如直接写信问开发者
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2017-6-20 03:52:19 | 只看该作者 Only view this author
qiongxie 发表于 2017-6-1 18:15
这个是出现上述问题的com 和log

Sorry for replying in English. I don't know Chinese!
You'd better to limit the resonance system via <> after $NRT keyword. for your case, it should be like that:
$NRT <1 2 3 4 5 6 9 10 12 13 17 18 19> NRTRES=2000 NRTREF=300 $END
in which, NRT just analyses the resonancy for atoms mentioned in <>. hope it helps.

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-2 12:02:20 | 只看该作者 Only view this author
drkiwi 发表于 2017-6-20 03:52
Sorry for replying in English. I don't know Chinese!
You'd better to limit the resonance system v ...

thanks

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