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[GROMACS] 如何快速知道哪个力场和水模型适合自己的蛋白体系

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蛋白力场有很多,水模型也有和很多,如何知道哪个组合最适合自己的蛋白体系?求教,谢谢!

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发表于 Post on 2026-2-5 00:10:57 | 只看该作者 Only view this author
力场的原文/相关说明通常都有写的,也有不少横测的文章讨论。一般蛋白如AmberFF14SB+TIP3P、Amberff19SB+OPC、CHARMM36+优化过的TIP3P;IDP专用力场等。
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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发表于 Post on 2026-2-5 04:05:19 | 只看该作者 Only view this author
这些关键性知识在北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/KGMX)都讲得非常详细,参见培训里“溶剂模型”部分这页幻灯片:
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-2-5 10:57:58 | 只看该作者 Only view this author
student0618 发表于 2026-2-5 00:10
力场的原文/相关说明通常都有写的,也有不少横测的文章讨论。一般蛋白如AmberFF14SB+TIP3P、Amberff19SB+OP ...

好的,谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-2-5 10:58:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-2-5 04:05
这些关键性知识在北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/KGMX)都讲得非常详细,参见 ...

好的,谢谢!

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