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[VMD] VMD里给相互作用的两个分子分别用两种显示方式和颜色应该怎么做呢?

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各位老师好,我想用VMD画一个这样的图 ,即给相互作用的两个分子分别用两种显示方式和颜色。应该怎么做呢?

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发表于 Post on yesterday 20:53 | 只看该作者 Only view this author
分组着色。
本人五年COMSOL有限元模拟+三年DFT与MD理论学习,2+3联合培养项目毕业,在英期间做过计算机视觉相关AI应用工作。目前正在寻找国内外多尺度模拟方向的PhD职位。感兴趣的老师请私信我。

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发表于 Post on yesterday 21:01 | 只看该作者 Only view this author
例如一个用 name, 一个用type, 然后color那边分别改 name 和type对应原子的颜色。
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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发表于 Post on 7 hour ago | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “VMD调色” 改了,以后务必注意!下次将删帖+扣分处理。

当前问题和波函数分析、Multiwfn毫无直接联系,别随便发到波函数分析与Multiwfn版块,这次给你移动了,以后注意!
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 5 hour ago | 只看该作者 Only view this author
两个分子分成两个pdb,分别载入

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 楼主 Author| 发表于 Post on 4 hour ago | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 微塑料 于 2026-3-12 10:01 编辑

如何单独改变以VDW方式(看起来很粗的分子)显示的分子的颜色呢?比如把单独把这个长链(粗的分子)的碳原子的颜色改成黄色,H原的颜色改成蓝绿色, ,让这个体系不会有那么多原子重叠。

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发表于 Post on 3 hour ago | 只看该作者 Only view this author
微塑料 发表于 2026-3-12 09:58
如何单独改变以VDW方式(看起来很粗的分子)显示的分子的颜色呢?比如把单独把这个长链(粗的分子)的碳原 ...

VDW那个的Coloring method换 type,Main选单Graphics - Color 弹出的视窗找type换掉C H的颜色。
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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