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[新手求助] 求助NO2+进攻乌洛托品过程,柔性扫描应该怎么定位特定的C-N断裂?

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      在复现一篇文献的乌洛托品(六亚甲基四胺)硝解反应的DFT计算,在复现过程中,我使用了与文章中相同的初始结构(乌洛托品,由剑桥晶体学数据中心获得)、理论方法和基组(m062x/6-311G(d)),引入了SMD模型来模拟发烟硝酸环境。然而,经过很多尝试,我找到的过渡态虚频(-363 cm-1,文章中是-317cm-1)以及后续IRC两端优化的反应物与产物的E+ZPE差值(shermo程序计算)与文章结果存在较大偏差,由于此前是根据文献图片手搭的,所以怀疑是过渡态初猜结构没有搭好,现在想尝试柔性扫描帮忙找过渡态。
      柔性扫描思路是让硝化剂NO2+去靠近乌洛托品中的N原子,把NO2+与N原子距离从1.5扫到1.3埃,但结果是能量一直在增长(文献里过渡态时的距离是1.4埃),并且乌洛托品的三个C-N键同时拉长且没有一个是显著于其它两个拉长的,这与文献仅断裂一个C-N键不符,求助大佬们这种硝解反应应该怎么设置柔性扫描?

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扫描结果

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乌洛托品硝解过程

乌洛托品硝解过程

HA-fumnitric-TS-softscan.gjf

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柔性扫描

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发表于 Post on 2026-3-27 13:32:55 | 只看该作者 Only view this author
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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