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[综合交流] 求助:关于使用CP2K配合Multiwfn和Sobtop生成非标准氨基酸力场参数的疑问

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各位老师们好, 最近我正在尝试为GROMACS生成非标准氨基酸残基的拓扑文件,参考了Sobtop官方FAQ5 (http://sobereva.com/soft/Sobtop/#download)的流程,我打算使用CP2K完成前期的量子化学计算。但在实操中遇到了一些细节疑惑,特来请教:
1. cp2k是否可以完全代替Gaussian和ORCA进行几何优化和振动分析呢,因为我看到http://sobereva.com/651这里Sobereva老师有提到可以用cp2k的 .molden文件进行处理后输入进Multiwfn?
2. 我已经使用CP2K进行了几何优化和振动分析,但在振动分析中开启.Molden 输出后,得到了很多文件。请问用于拟合RESP电荷的波函数,我该选择用哪个文件呢?我是否应该在几何优化完成后,单独拿优化好的最优坐标,跑一次 RUN_TYPE=ENERGY 的单点计算,来提取唯一正确的.Molden 输入给Multiwfn?

感谢各位前辈百忙之中答疑!

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发表于 Post on yesterday 20:16 | 只看该作者 Only view this author

http://sobereva.com/soft/Sobtop/#download  中说的很清楚,用量子化学程序来计算。

常用的CP2K是第一性原理程序,Gaussian和ORCA是量子化学程序。
又菜又爱玩

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发表于 Post on 20 hour ago | 只看该作者 Only view this author
对小分子做优化和振动分析,CP2K远不如Gaussian等量子化学程序,效率低、几何优化和SCF收敛性相对差,虽然用也能用。拿优化完的结构算个单点得到molden文件。

除非要让sobtop基于CP2K的Hessian计算内坐标力常数,否则振动分析并不需要(此时振动分析的意义仅在于确认有没有虚频)
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 11 hour ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-5-28 01:36
对小分子做优化和振动分析,CP2K远不如Gaussian等量子化学程序,效率低、几何优化和SCF收敛性相对差,虽然 ...

谢谢老师的解答!我还想再请教一下,如果在无法使用Gaussian/ORCA的情况下,对于这种ncaa小体系参数化(几何优化、Hessian)任务,是否可以考虑使用 xTB 来做优化和Hessian计算?相比CP2K,会不会更适合这类小分子体系的workflow?

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