关于MD和DFT分析反应路径的疑问。

troll

各位老师，大家好，
       我最近阅读了一篇文献The intrinsic mechanism of methane oxidation under explosion condition: A combined ReaxFF and DFT study。文中采用了reaxff和DFT方法对甲烷氧气的反应进行了分析。请问fig.3中的反应路径是如何得到的？（文中没有写出）

winterzen

ReaxFF-MD模拟后可以进行 fragments/species 分析，就是他们论文中图1和2的分析。依据各个碎片物种出现的时间段和分布可以对反应历程进行初步判断。然后可以看MD的轨迹，能够跟踪到每种物种是如何随时间变化的。再就是依据化学常识和直觉可以猜测各个物种可能的反应路径。综合这些分析获得主要反应路径。

troll

@winterzen 您分析的很有道理，和我猜想的一样，这篇文章随后采用DFT方法逐个对可能的反应路径进行分析验证的。