GROMACS有簡易辦法做到任務排程嗎?

HarrisLin

這是一個比較偏向懶人的尷尬問題
因為我們實驗室目前有人需要跑50ns長度的MD(反推約13/14小時)
但是他體系一天主機運算效率是90ns
我們實驗室是早九到晚九所以進度上有點尷尬
沒辦法完全讓任務先後銜接起來
所以想問問看前輩們有辦法做到任務排程讓他接著跑
還是應該早上九點丟新任務下去跑
晚上九點再丟一個任務下去卡位等早上任務結束呢?
謝謝

ggdh

无脑写个shell脚本就行了。
你要是不会写，可用把你提交任务的没一个步骤详细写出来。就会有人给你写个。

HarrisLin

ggdh 发表于 2017-6-3 21:44
无脑写个shell脚本就行了。
你要是不会写，可用把你提交任务的没一个步骤详细写出来。就会有人给你写个。

其實我只需要能自動依序執行
gmx mdrun -deffnm md -cpi md.cpt -v -append
讓不同任務能依序續跑指令就好

liyuanhe211

HarrisLin 发表于 2017-6-3 23:41
其實我只需要能自動依序執行
gmx mdrun -deffnm md -cpi md.cpt -v -append
讓不同任務能依序續跑指令 ...

将所需的输入输出都用完整路径表示（保险起见）、每个任务的命令占一行写到一个文本文件里，直接用sh运行这个文件就可以了。