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[GROMACS] GROMACS做能量最小化的问题

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老师们好,最近用gromacs跑动力学发现,在最小化的时候,有某些步数里面没有数据,但仍能正常结束得到em.log和em.gro。请问这会影响接下来的退火和MD吗?(多次跑动力学发现有时候md能继续进行,有时候不能。)请问这是不是和em中的缺失的步数有关呢?

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发表于 Post on 2017-6-13 21:28:23 | 只看该作者 Only view this author
只要EM之后的结构合理,MD能正常跑起来,就没事
即便MD跑不起来也和这个没直接关系
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