原子簇计算问题

niobium · 发表于 Post on 2017-7-3 22:34:33

请问老师，现在遇到这么一个问题，不知可以如何解决。

实验上用水热法合成一个金属氧化物的簇，在体系中加入微量的硅酸之后，生成了新的簇，新的簇能量应该是比原来的簇更低，理论计算里面可否做某种计算来支持这一过程，也就是如何用理论说明新生成的簇的能量更低。簇的晶体结构已经解出来了，大概300个原子。

谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2017-7-4 01:29:50

老的和新的簇结构都有了？这样的话直接算算能量来对比
300个原子的话，DFT还是能算得动的，特别是ORCA下用纯泛函结合def2-SVP并且开RI时

niobium · 发表于 Post on 2017-7-4 03:43:20

sobereva 发表于 2017-7-4 01:29
老的和新的簇结构都有了？这样的话直接算算能量来对比
300个原子的话，DFT还是能算得动的，特别是ORCA下用 ...

谢谢sob老师。
我在原帖中忘了提了，老的和新的簇的组成是不一样的，并不是同分异构体，不知道在这种情况下直接比较能量是否有意义？

sobereva · 发表于 Post on 2017-7-4 05:23:47

niobium 发表于 2017-7-4 03:43
谢谢sob老师。
我在原帖中忘了提了，老的和新的簇的组成是不一样的，并不是同分异构体，不知道在这种情 ...

没法比
必须各个元素的原子数都相同才能比

niobium · 发表于 Post on 2017-7-4 05:30:30

sobereva 发表于 2017-7-4 05:23
没法比
必须各个元素的原子数都相同才能比

那是不是得写出一个

老簇＋硅酸－－> 新簇

的方程式来，当作一个化学反应来研究？

sobereva · 发表于 Post on 2017-7-4 05:43:27

niobium 发表于 2017-7-4 05:30
那是不是得写出一个

老簇＋硅酸－－> 新簇

关于你的具体体系我不清楚，反正两边得配平能量才有得比

niobium · 发表于 Post on 2017-7-4 05:49:01

sobereva 发表于 2017-7-4 05:43
关于你的具体体系我不清楚，反正两边得配平能量才有得比

好的。谢谢！

winterzen · 发表于 Post on 2017-7-4 10:28:53

簇生长、晶体结晶过程向来比较复杂。对于你描述的体系可能涉及新簇的“成核 --> 生长”机制，或者硅酸诱发旧簇发生固态转变形成新簇机制，或者更加复杂。除了对物种能量进行比较外（即考察热力学控制因素），过程中的动力学控制因素往往不能忽视。
如果计算硬件条件允许，可以考虑使用一些较快的软件（如CP2K、SIESTA）进行AIMD模拟，或进行DFTB-MD模拟（如果有参数），直接观察过程中的动态变化，或许能得到簇形成初期阶段的机制信息。
再或者设计旧簇变成新簇的详细反应路径，计算energy profile，这对化学直觉要求较高、主观性也多一些。

niobium · 发表于 Post on 2017-7-4 10:56:16

winterzen 发表于 2017-7-4 10:28
簇生长、晶体结晶过程向来比较复杂。对于你描述的体系可能涉及新簇的“成核 --> 生长”机制，或者硅酸诱发 ...

谢谢！

ikea1984 · 发表于 Post on 2017-7-5 00:01:49

比较化学势可否？在固体材料和表面上较为常见

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[综合交流] 原子簇计算问题

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