3000条小肽的结构预测与PDB粗略构建

tomwong4253 · 发表于 Post on 2017-7-5 14:06:34

如题，各位同事是否知道哪个软件或在线预测结构的可以做3000条短肽（每条100氨基酸左右）的PDB结构预测，不需要太准确。
一条一条上传SWISS MODEL太慢，而且传多了服务器还会ban我。
不用很准确，就是quick and dirty地先出一套数据就好。

tianflame · 发表于 Post on 2017-7-6 12:38:07

我知道rosetta软件可以实现这个功能，下面是一个在线的服务器，不知是否可以？

http://robetta.bakerlab.org/documents.jsp

kunkun · 发表于 Post on 2019-5-10 11:37:42

tianflame 发表于 2017-7-6 12:38
我知道rosetta软件可以实现这个功能，下面是一个在线的服务器，不知是否可以？

http://robetta.bakerl ...

100个AA的多肽。3000条计算量我估计是极大的。。。不建议。如果每条是10个氨基酸，可以尝试rosetta 迅速获得。

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[蛋白质建模] 3000条小肽的结构预测与PDB粗略构建