vasp做过渡态经验<二>：Dimer

phoenix · 发表于 Post on 2023-5-15 09:31:47

郑明发表于 2023-5-14 21:50
没有用过这个脚本，另外你复制一个OUTCAR到目录下不就能验证你的想法了吗。

谢谢，已经解决了，不是OUTCAR的问题

小徐不激动 · 发表于 Post on 2023-6-7 13:54:05

求助，为什么我点开链接之后没有上面所说的脚本

Yun_ZL · 发表于 Post on 2023-7-5 18:53:41

我有一个困惑，Dimer每一个step中旋转的次数必须要保证Torque和Angel收敛到1以下吗？当我的RotMax参数使用默认值4时，Torque和Angel都远大于1，Torque从20减小到10左右，Angel从20减小到8左右，曲率C是逐渐变小的，那这个RotMax=4是否合理呢？

gejuqing · 发表于 Post on 2023-11-28 15:46:07

$ modemake.py freq9
Usage: modemake.py freqfile scale
Please try again!

复制代码

请问一下，这个scale参数是什么意思啊，好像脚本又更新了？

Yeji · 发表于 Post on 2024-1-22 14:06:44

Another possible choice is the vector between initial and final states, or between a known minimum and the initial POSCAR file. To generate a MODECAR file as the direction between two configurations, use the modemake.pl script
脚本用法 modemake.pl ini/POSCAR fin/POSCAR,生成MODECAR

Stars · 发表于 Post on 2024-1-27 16:19:38

Yun_ZL 发表于 2023-7-5 18:53
我有一个困惑，Dimer每一个step中旋转的次数必须要保证Torque和Angel收敛到1以下吗？当我的RotMax参数使用 ...

不是必须。初猜很差的时候很可能好多步Torque和Angle都不收敛

Elden、Lord · 发表于 Post on 2024-2-13 18:22:59

老师，您的imagefreq.py 脚本在网站里找不到了，您能发给我一份吗？不胜感激

qyw · 发表于 Post on 2024-6-3 19:54:21

DavyHou 发表于 2017-12-26 21:55
Dimer_test$ python imagefreq.py
imagefreq.py:26: Warning: 'with' will become a reserved keyword in ...

这个脚本您还有吗，已经找不到了

ljb874722957 · 发表于 Post on 2024-8-30 15:40:03

Traceback (most recent call last):
File "./freqmov.pl", line 79, in <module>
freq_pos, vibration = readFreq(freq_file)
File "./freqmov.pl", line 36, in readFreq
dcoordinates.append(np.array([line[3], line[4], line[5]]))
IndexError: list index out of range
出现这种错误是为什么呢？请教一下各位大佬

billcsu · 发表于 Post on 2024-9-19 18:06:34

Elden、Lord 发表于 2024-2-13 18:22
老师，您的imagefreq.py 脚本在网站里找不到了，您能发给我一份吗？不胜感激

仔细翻看这个帖子，所有问题的内容基本都已经回答过了

单单 · 发表于 Post on 2024-9-27 17:28:01

请问dimer计算完之后，应该怎么做呢？直接把dimer的结果当成过渡态吗？

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