vasp做过渡态经验<二>：Dimer

lin2206 · 发表于 Post on 2025-2-10 20:31:05

小徐不激动发表于 2023-6-7 13:54
求助，为什么我点开链接之后没有上面所说的脚本

有的脚本名字不一样

CHLllooll · 发表于 Post on 2025-3-3 10:41:57

DavyHou 发表于 2017-12-26 21:55
Dimer_test$ python imagefreq.py
imagefreq.py:26: Warning: 'with' will become a reserved keyword in ...

您好，请问在做过渡态搜索的时候能否只是用dimer，因为我做的大体系跑CI-NEB实在是太慢了；使用dimer跑出来的过渡态有且仅有一个虚频并且虚频振动方向是反应物和产物之间，这个过渡态结果能否直接使用呢

DavyHou · 发表于 Post on 2025-3-5 09:28:17

本帖最后由 DavyHou 于 2025-3-5 09:37 编辑

CHLllooll 发表于 2025-3-3 10:41
您好，请问在做过渡态搜索的时候能否只是用dimer，因为我做的大体系跑CI-NEB实在是太慢了；使用dimer跑出 ...

如果你的始、终结构比较简单的话可以。如果始、终结构差距比较大的话可能有问题。因为在用CI-NEB计算时，有可能发现局域最小值，将一步反应转换为两步甚至多步反应，这样就有多个过渡态。对于复杂体系，只用dimer计算的话，可能只发现其中的一个过渡态。对于大体系，推荐使用低精度跑CI-NEB，确保能量曲线类似于开口向下的二次曲线而不是M形状后再跑dimer。

mah · 发表于 Post on 2025-3-17 18:20:11

DFT搬砖工发表于 2020-6-25 12:08
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您好，遇到了和您一样的报错，请问解决了吗

小张要努力 · 发表于 Post on 2025-9-22 10:00:46

请问一下大家：找到需要的虚频“比如找到的是freq24”。这里的虚频24指的是要留下的虚频还是要消除的虚频呢？望大家答疑，感谢您们！

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