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[综合交流] How to calculate potential energy surface ?

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As I'm not familiar with quantum chemical calculation, I would like to ask you how to calculate the potential energy surface ?
The case is described as tiny particles adsorb inside CNT model, which is got by MD simulation. "The potential energy surface of the interaction between a molecule and the wall was scanned at he", the paper said.
For me, the simplest way to obtain the values is Material studio. Could you give me some clues ? Thanks.

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发表于 Post on 2015-3-27 03:28:34 | 只看该作者 Only view this author
文中得到的准确来说不是势能面(3N-6维),而是势能曲线,是一维的。
可以基于分子力学也可以基于量子化学获得,取决于你需要的精度和能接受的耗时。只要程序能算能量,就可以通过对二者间距进行扫描能得到这样的势能曲线。简单来说,就是把二者摆成不同间距,计算能量,然后绘制 能量vs间距 的曲线。
比如基于分子力学可以用gromacs、amber、NAMD、MS等等;基于量子化学可以用Gaussian、ORCA等
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-3-27 09:58:12 | 只看该作者 Only view this author
Thanks, sob. it's really helpful for me. Using QCC means time consuming. I would like to just calculate the potential energy using equation of U.

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