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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn资源与经验] 在Multiwfn中基于fch产生自然轨道的方法与激发态波函数、自旋自然轨道分析实例

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发表于 Post on 2020-11-5 21:17:44 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 陈丢丢 于 2020-11-5 21:24 编辑
sobereva 发表于 2020-11-4 14:46
molden文件不记录原子的实际核电荷数信息(原子序数扣除被赝化的电子数),所以重新载入molden后程序就不 ...

sob老师好,我现在算一个金属体系,fe、K用的LANL2DZ,其他原子用的6-31G*。目前想对这个体系做自旋自然轨道分析,同样遇到了“molden文件不记录原子的实际核电荷数信息”这个问题,我修改了molden文件里面fe和K的核电子数,将修改后的molden文件重新拉入Multiwfn中,但是还是报错,是因为我修改数据错误吗?我将fe和K的核电子数改成16和9C:\Users\dell\Desktop\计算SNO报错.png。此外如果我用高斯算自旋自然轨道,产生wfn文件,用wfn文件进行SNO分析的话,是用Multiwfn直接看轨道吧?用的关键词是:
ub3lyp/genecp Pop=spinnatural out=wfn geom=connectivity empiricaldispersion=gd3
*****
*****
ts5-p-t-k-top-sno.wfn

计算SNO报错.png (198.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 143)

计算SNO报错.png

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发表于 Post on 2020-11-5 22:19:24 | 只看该作者 Only view this author
陈丢丢 发表于 2020-11-5 21:17
sob老师好,我现在算一个金属体系,fe、K用的LANL2DZ,其他原子用的6-31G*。目前想对这个体系做自旋自然 ...

检查一下molden文件的轨道占据数对不对?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-6 02:27:28 | 只看该作者 Only view this author
陈丢丢 发表于 2020-11-5 21:17
sob老师好,我现在算一个金属体系,fe、K用的LANL2DZ,其他原子用的6-31G*。目前想对这个体系做自旋自然 ...

今天我更新了官网上的Multiwfn最新版本,此功能输出.mwfn格式代替了老版本的.molden格式,完全没这个问题了。

Gaussian计算时候写Pop=spinnatural是完全多余的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-6 03:33:23 | 只看该作者 Only view this author
Novice 发表于 2020-11-3 16:48
Sob老师,请问我在做TD-DFT计算时只加了density关键词(# B3LYP/genecp TD density; Ir 使用SDD, 其它原子使 ...

目前最新版本已改成输出mwfn格式了

还有一些原本输出molden文件的功能我也都改成输出mwfn格式了,完全杜绝了这个问题

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发表于 Post on 2020-11-6 14:40:36 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-5 22:19
检查一下molden文件的轨道占据数对不对?

好的,我检查下,谢谢您!

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发表于 Post on 2020-11-6 14:41:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-6 02:27
今天我更新了官网上的Multiwfn最新版本,此功能输出.mwfn格式代替了老版本的.molden格式,完全没这个问题 ...

谢谢sob老师,我下载最新的Multiwfn软件进行分析!

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发表于 Post on 2020-11-6 14:44:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-6 03:33
目前最新版本已改成输出mwfn格式了

还有一些原本输出molden文件的功能我也都改成输出mwfn格式了,完全 ...

Sob老师,我刚才迫不及待试了下,发现分析ADCH电荷时基于gaussian直接输出的wfn文件计算出的Ir的hirsfeld电荷为0.28,而基于mwfn文件计算出的hirsfeld电荷为0.30。其它原子的差别却小一些(大概是在小数点后四位以后)。最终的ADCH电荷也有一定不同。是因为mwfn文件的数字有效位数较少,还是有什么bug?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-6 15:12:17 | 只看该作者 Only view this author
Novice 发表于 2020-11-6 14:44
Sob老师,我刚才迫不及待试了下,发现分析ADCH电荷时基于gaussian直接输出的wfn文件计算出的Ir的hirsfeld ...

明明是mwfn格式有效位数更多,所以说mwfn是记录波函数最完美的格式
差异更大可能是来自于产生自然轨道的细节上。这点差异完全可以忽略。
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发表于 Post on 2022-8-8 21:47:15 | 只看该作者 Only view this author
卢老师,请问您:由本文中方法与基态中所计算的结果相对比得出的结论,如键级的降低,可以描述为分子(基态)在某波长光(跃迁到某个态)下的响应吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-9 05:57:26 | 只看该作者 Only view this author
上善若水 发表于 2022-8-8 21:47
卢老师,请问您:由本文中方法与基态中所计算的结果相对比得出的结论,如键级的降低,可以描述为分子(基态 ...

你可以说吸收了某个频率的光,激发到某激发态后,键被削弱了
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发表于 Post on 2025-3-16 10:41:41 | 只看该作者 Only view this author
使用orca做tddft/post-HF如何产生对应的自然轨道

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-17 11:51:51 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2025-3-16 10:41
使用orca做tddft/post-HF如何产生对应的自然轨道

ORCA没法直接产生TDDFT的自然轨道,但结合Multiwfn可以得到对应非弛豫激发态密度的自然轨道。参考北京科音高级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KAQC)的幻灯片:


后HF具体看什么方法,例如MP2

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