计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: yjmaxpayne
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[xtb] XTB出新版咯:GFN2-xTB,大家踊跃申请使用哦

[复制链接 Copy URL]

330

帖子

0

威望

3016

eV
积分
3346

Level 5 (御坂)

计算化学路人甲

16#
发表于 Post on 2019-3-13 15:51:54 | 只看该作者 Only view this author
IIIIO_OIIII 发表于 2019-3-13 15:42
如果我有什么进展,我会回复给你。你为什么不用Molclus作conformer search呀?体系太大了吗?

我经常做的是单分子的构象搜索,以前都是用Win下的GMMX进行的,感觉分子稍微大一点就太慢了。我看社长教程里构象搜索退火用的是Amber,最近新装工作站,装软件弄得我心力憔悴,就不想再折腾了,所以想试试在工作站上用装好的XTB做退火,然后结合molclus做构象搜索筛选

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125156

管理员

公社社长

17#
发表于 Post on 2019-3-14 04:50:07 | 只看该作者 Only view this author
Novice 发表于 2019-3-13 15:51
我经常做的是单分子的构象搜索,以前都是用Win下的GMMX进行的,感觉分子稍微大一点就太慢了。我看社长教 ...

"molclus得结合amber才能用"这是天大的误解
正是为了避免使用者非得会MD才能用molclus,后来特意开发了gentor和genmer,作为molclus包中的重要组成部分。有了这俩东西,大多数使用molclus的情况完全不需要牵扯到MD程序
gentor:扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html
genmer:生成团簇初始构型的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html

molclus一直在不断更新和改进,博文内容也在不断更新和修改
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 23:23 , Processed in 0.180754 second(s), 19 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list