gaussian 计算freq 计算时间短并且未报错直接退出问题求助

ipoy

请各位大神帮忙看看小弟的计算。
计算一个含有C, H, O, Na, Li, Si 的一个94原子组成的小分子。想要计算NBO轨道。

我用opt用这个方法和基组计算了该分子，在我们的服务器上计算了4天计算出来。
但是加入freq,没算几分钟就停止了，没有提示是什么原因终止的。

我已经用该方法计算了另一个分子，不含有Na原子的分子，可以计算出来，NBO轨道也能画出来。

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输入文件：
%Nproc=16
%mem=64GB
#p freq M062x/6-31+g(d) nosymm
pop=(full,nboread)

NAME

坐标

$nbo
bndidx
plot file=NAME
$end
******************************************************************************
输出文件：（节选）

**** Warning!!: The largest alpha MO coefficient is  0.11540839D+03

Leave Link  801 at Thu Apr 26 18:57:15 2018, MaxMem= 8589934592 cpu:       0.4
(Enter /home/315/g09/l1101.exe)
Using compressed storage, NAtomX=    94.
Will process  95 centers per pass.
Leave Link 1101 at Thu Apr 26 18:57:19 2018, MaxMem= 8589934592 cpu:      66.1
(Enter /home/315/g09/l1102.exe)
Symmetrizing basis deriv contribution to polar:
IMax=3 JMax=2 DiffMx= 0.00D+00
Leave Link 1102 at Thu Apr 26 18:57:20 2018, MaxMem= 8589934592 cpu:       3.5
(Enter /home/315/g09/l1110.exe)
Forming Gx(P) for the SCF density, NAtomX=    94.
Integral derivatives from FoFDir/FoFCou, PRISM(SPDF).
Do as many integral derivatives as possible in FoFDir.
G2DrvN: MDV=    8589933736.
G2DrvN: will do    95 centers at a time, making    1 passes doing MaxLOS=2.
Calling FoFCou, ICntrl=  3107 FMM=T I1Cent=   0 AccDes= 0.00D+00.
FoFCou: FMM=T IPFlag=           0 FMFlag=      100000 FMFlg1=        2001
         NFxFlg=           0 DoJE=F BraDBF=F KetDBF=F FulRan=T
         Omega=  0.000000  0.000000  1.000000  0.000000  0.000000 ICntrl=    3107 IOpCl=  0
         NMat0=    1 NMatS0=    1 NMatT0=    0 NMatD0=    1 NMtDS0=    0 NMtDT0=    0
         I1Cent=           0 NGrid=           0.
Symmetry not used in FoFCou.
FMM levels:  10  Number of levels for PrismC:   9
************************************************************************************
标题不对，或者板块错误，请版主及时纠正。
小弟万分感谢！！！

sobereva

表述太混乱。freq是freq、NBO是NBO，无直接关系的问题不要掺和在一起提
输出的信息表明明显还没做到NBO的步骤，还在做freq
大体系freq是非常耗时间的

ipoy

sobereva大神，是这样，我先单独的做了一个opt，算了好久才算出来。我把算出来的结构使用freq来算，不到一个小时就退出来了，而且还没有报错。想问一下是什么原因。

gauss98

ipoy 发表于 2018-4-27 08:46
sobereva大神，是这样，我先单独的做了一个opt，算了好久才算出来。我把算出来的结构使用freq来算，不到一 ...

算freq时有内存问题

设置内存不要超过物理内存的一半

ipoy

gauss98 发表于 2018-4-27 08:57
算freq时有内存问题

设置内存不要超过物理内存的一半

感谢，我试一下.......

ipoy

gauss98 发表于 2018-4-27 08:57
算freq时有内存问题

设置内存不要超过物理内存的一半

经过我把%mem=64GB改成32之后，这个问题还是没有得到解决。能不能我帮在想想想是什么原因。


我想问一下，chk文件的作用是什么？我用opt计算时，没有chk文件就能计算出来。但是我觉得用freq计算没chk文件不行吧？我又加上chk文件试了一试，看看效果如何。
@sobereva

sobereva

ipoy 发表于 2018-4-27 10:14
经过我把%mem=64GB改成32之后，这个问题还是没有得到解决。能不能我帮在想想想是什么原因。

这和你设不设%chk完全无关
就算你不写%chk，实际上运算过程中chk文件还是会产生在临时文件目录里
如果算到那里莫名其妙就中断了，换个Gaussian版本再试