求助，电子密度拉普拉斯等值线图怎样和分子对应起来

郭严1993 · 发表于 Post on 2015-5-13 20:17:21

这是我要分析的分子，分析该分子的亲电活性位点

但是不知道，这两张图要怎么对应起来，特别恳请大师是给指点指点。。。（现在，对于亲点活性位点分析，我看了不少Sob老师发的文章，看的时候很清楚，这回脑子就又像一团浆糊了。。。）
谢谢您的帮助~

sobereva · 发表于 Post on 2015-5-13 20:54:03

怎么对应取决于你作平面图的时候怎么定义的平面，这个自己最清楚。
如果是弄不清平面图中的原子和三维图中原子的对应关系，可以把settings.ini里的iatmlabtype设为3，这样绘制出的平面图上的原子标签会带着原子序号，便于和三维图上的原子对应。

这种图对于判断亲电活性位点用处不大。福井函数、双描述符、平均局部离子化能那些有用得多。

郭严1993 · 发表于 Post on 2015-5-13 21:21:42

sobereva 发表于 2015-5-13 20:54
怎么对应取决于你作平面图的时候怎么定义的平面，这个自己最清楚。
如果是弄不清平面图中的原子和三维图中 ...

谢谢老师,我换个方法试试

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