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[配置讨论] 这个配置跑Gaussian/orca和gromacs可以吗

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请问这个工作站配置合理吗?
模拟以分子动力学为主,量化为辅

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发表于 Post on 2025-4-27 17:41:48 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 tonganlhy 于 2025-4-27 18:34 编辑

分子动力学和量化对单核性能的要求不同。分子动力学需要单核主频高的。量化如果任务多,核数很关键。
如果你需要同时跑两个分子动力学任务,同时还要兼跑量化,那么妥协一下,这个配置可以,但是表现不如配一台7950X+64G+4080*2 加一台7r32单路。
如果你需要同时跑两个分子动力学任务,量化只是偶尔做做,那么可以配两台7950X+64G+4080。
如果你只需要跑一个分子动力学任务,还希望同时跑量化,那么配一台7950X+64G+4090 加一台7r32单路。
主板可以换成技嘉MZ72-HB2,便宜一点。H12DSi-N6这个价位要小心,正常卖价是比这个高的。
5080目前很多软件的适配性不好,如果要马上上手不建议使用。
另外内存要看一下是不是超频的。
三星固态注意0E问题。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-28 09:19:57 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 古与春分 于 2025-4-28 09:28 编辑
tonganlhy 发表于 2025-4-27 17:41
分子动力学和量化对单核性能的要求不同。分子动力学需要单核主频高的。量化如果任务多,核数很关键。
如果 ...

感谢大神的指点,我是同时跑两个分子动力学任务,量化只是偶尔做做,您看看这个配置可以吗。或者显卡换成4070ti和5070ti合理不C:\Users\15180\Desktop/工作站配置.png

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发表于 Post on 2025-4-28 09:37:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 tonganlhy 于 2025-4-28 10:01 编辑
古与春分 发表于 2025-4-28 09:19
感谢大神的指点,我是同时跑两个分子动力学任务,量化只是偶尔做做,您看看这个配置可以吗。或者显卡换成 ...


你这个方案是不行的。7950X不能用在MZ72-HB2主板上。
你这种情况如果预算低,那么配两台7950X+64G+4080,具体参考http://sobereva.com/444
CPU:AMD Ryzen 9 7950X(16核,散片,集显)
主板:技嘉B650M AORUS ELITE 小雕 或者850M
硬盘:企业级 8TB 256MB 7200rpm SATA3 (ST8000NM017B)   + 500G或者1T固态(系统盘),分子动力学要有机械盘作为数据存储,读写要求倒不高
显卡:RTX4080 super 或者 5080
内存:32GB*2 DDR5-6000

如果预算高
可以配一台
CPU:AMD Ryzen 9 7950X(16核,散片,集显)或者9950X
主板:X670E 或者 X870E,注意选有两个PCIE 5.0 x 8 接口的(一般一个是 x 16,另一个是 x 8,两个显卡就只能都 x 8)
硬盘:企业级 8TB 256MB 7200rpm SATA3 (ST8000NM017B)   + 500G或者1T固态(系统盘),分子动力学要有机械盘作为数据存储,读写要求倒不高
显卡:RTX4080 super 或者5080 *2 (机箱要买够大可以放两个显卡)
内存:32GB*2 DDR5-6000

加一台单路7K62或者7R32 (如果考虑以后升级,预算也够,也可以7532双路+技嘉MZ72-HB2,以后可以升级到7B13或者7C13双路)
CPU:7R32或者7K62
主板:技嘉MZ32-AR0
硬盘:1T固态*2
内存:16GB*16 DDR4-2666

这样差不多了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-28 10:18:19 | 只看该作者 Only view this author
tonganlhy 发表于 2025-4-28 09:37
你这个方案是不行的。7950X不能用在MZ72-HB2主板上。
你这种情况如果预算低,那么配两台7950X+64G+408 ...

感谢大神!!!对于显卡的话,4070 4070ti 4080 5070 5070ti 5080又该如何选择了

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发表于 Post on 2025-4-28 10:40:12 | 只看该作者 Only view this author
古与春分 发表于 2025-4-28 10:18
感谢大神!!!对于显卡的话,4070 4070ti 4080 5070 5070ti 5080又该如何选择了

这个看预算。预算够的话,5080性价比最高,如果可以等软件适配,那没问题。如果不行,那4080 super也不会差多少。预算再不够就逐级下降

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-28 10:52:13 | 只看该作者 Only view this author
tonganlhy 发表于 2025-4-28 10:40
这个看预算。预算够的话,5080性价比最高,如果可以等软件适配,那没问题。如果不行,那4080 super也不会 ...

软件适配是指什么了,不适配的话对packmol、gmx、vmd会有什么影响了

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发表于 Post on 2025-4-28 12:27:42 | 只看该作者 Only view this author
古与春分 发表于 2025-4-28 10:52
软件适配是指什么了,不适配的话对packmol、gmx、vmd会有什么影响了

这个要看具体软件。有些没更新或者你要用旧版本的话5080可能会有问题。如果想保险一点就用4080 super好了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-28 15:02:00 | 只看该作者 Only view this author
tonganlhy 发表于 2025-4-28 12:27
这个要看具体软件。有些没更新或者你要用旧版本的话5080可能会有问题。如果想保险一点就用4080 super好了 ...

好的好的,感谢感谢

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发表于 Post on 2025-6-16 07:28:05 | 只看该作者 Only view this author
tonganlhy 发表于 2025-4-27 17:41
分子动力学和量化对单核性能的要求不同。分子动力学需要单核主频高的。量化如果任务多,核数很关键。
如果 ...

您好,想咨询您一些问题。目前自费购机,预算在1.3W或1.4W左右。需要跑量化和MD。看了一些帖子,发现跑量化,9950X的表现能和单路7R32一样。所以目前考虑9950X+4070ti,如果跑MD任务,就只跑MD;如果跑量化,就只跑量化,不会MD和量化一起跑;也不需要好多个Gaussian任务一起跑,如果9950X能和48核的单路7R32打平手,那我觉得跑量化的要求也能满足,任务一个一个交就是了。所以参照社长的推荐,打算用下面的配置,能否请您看一看有没有可以调整的地方,非常感谢!

CPU:AMD Ryzen 9 9950X(16核,散片,集显)
主板:技嘉B650M AORUS ELITE 小雕
散热器:酷冷至尊T400i简包装  80
显卡:技嘉RTX5070 风魔 12GB 5080元 或 微星 幻影师RTX5070 12G SHADOW 3X OC  5000元
硬盘:希捷 银河企业级 8TB 256MB 7200rpm SATA3 (ST8000NM017B)  1430
内存:2*48G
电源:先马黑钻850 V4  400
机箱:先马黑洞标准版  280

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发表于 Post on 2025-6-16 11:53:49 | 只看该作者 Only view this author
wbqdssl 发表于 2025-6-16 07:28
您好,想咨询您一些问题。目前自费购机,预算在1.3W或1.4W左右。需要跑量化和MD。看了一些帖子,发现跑量 ...

硬盘可以不用那么好的,配一个4T HDD(紫盘,JD大约600)加一个或者两个SSD(一个缓存一个系统)会比较好,量化计算有时候需要比较快的磁盘存储。如果急着开展工作,建议还是上4系的显卡。5系显卡的cuda驱动以及软件配套还不太成熟,可能比较折腾。

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发表于 Post on 2025-6-16 12:16:06 | 只看该作者 Only view this author
tonganlhy 发表于 2025-6-16 11:53
硬盘可以不用那么好的,配一个4T HDD(紫盘,JD大约600)加一个或者两个SSD(一个缓存一个系统)会比较好 ...

非常感谢您的回复,谢谢!

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