计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 12731|回复 Reply: 9
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 构型优化出问题

[复制链接 Copy URL]

33

帖子

0

威望

124

eV
积分
157

Level 3 能力者

在我用高斯优化构型的时候,老是算到这里就不算了,我保存了好几次总是这样,我想问一下这是什么原因?下面是out文件最后输出的结果:



下面是我的输入文件的关键词
# MP2/aug-cc-pVDZ opt=(cartesian maxcycle=400) freq scf(maxcycle=400) counter=3

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120109

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2015-5-21 19:09:02 | 只看该作者 Only view this author
用top看CPU占用率,应该还在算着
#应改成#P以便监控细节,免得表面上卡住而蒙在鼓里。
scf(maxcycle=400)、opt里的maxcycle=400毫无意义,应删掉
不要用counter=3。你已经有了弥散函数了,优化时用counterpoise对结果改进已经微乎其微,而由于此时没有解析梯度,优化耗时会增加一个数量级以上,频率计算耗时更是甚巨。
注意阅读输出文件,看当前已经算到什么位置了,是处在优化过程还是频率计算过程

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
hcxytpp@163.com + 4 赞!

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

2

帖子

0

威望

150

eV
积分
152

Level 3 能力者

3#
发表于 Post on 2015-5-21 20:37:19 | 只看该作者 Only view this author

33

帖子

0

威望

124

eV
积分
157

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-22 15:43:59 | 只看该作者 Only view this author
谢谢sob老师。

739

帖子

0

威望

1715

eV
积分
2454

Level 5 (御坂)

5#
发表于 Post on 2015-5-22 15:53:43 | 只看该作者 Only view this author
频率计算很占内存,大体系适当减小计算核心数目。

33

帖子

0

威望

124

eV
积分
157

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-22 15:54:28 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我其他的构型都用了counter=3,如果这个去掉,会有点差别吗?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120109

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2015-5-22 18:54:06 | 只看该作者 Only view this author
wang1345 发表于 2015-5-22 15:54
sob老师,我其他的构型都用了counter=3,如果这个去掉,会有点差别吗?

会有一丁点差别
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

33

帖子

0

威望

124

eV
积分
157

Level 3 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-23 12:39:17 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我按照您的建议改了一下,还是没有算过去,下面是out文件的最后,和以前比好像往下走了一点,但是还是停了。

下面是我改的输入文件#p MP2/aug-cc-pVDZ opt=cartesian  freq  

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120109

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2015-5-23 22:01:03 | 只看该作者 Only view this author
用top看看到底是否还在算着。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

33

帖子

0

威望

124

eV
积分
157

Level 3 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-25 08:33:24 | 只看该作者 Only view this author
我是用我们这的服务器算的,服务器上显示我的题已经掉下来了。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-14 06:48 , Processed in 0.199391 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list