计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 7702|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 三维分子怎么加电荷

[复制链接 Copy URL]

163

帖子

0

威望

1023

eV
积分
1186

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
高斯优化结构和能量后的分子的log文件用Avogadro另存为mol文件,再在materials studio里打开后,分子上的电荷不在了,请问大佬们这是为什么?
还有materials studio可以直接加电荷么?可以的话,怎么加?不可以的话,可以用什么软件加?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2018-11-13 16:46:14 | 只看该作者 Only view this author
mol本来就不含原子电荷信息
我不知道你加电荷是想干嘛,设这个对量化计算完全没影响,倘若是做基于分子力场的计算,自己在M$的图形界面里一个个设,或者试图写Perl脚本从外部文件读入,M$的一些基于分子力场的模块也可以通过某些规则计算出电荷。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

163

帖子

0

威望

1023

eV
积分
1186

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-13 16:50:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-13 16:46
mol本来就不含原子电荷信息
我不知道你加电荷是想干嘛,设这个对量化计算完全没影响,倘若是做基于分子力 ...

好的,谢谢sob老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 00:56 , Processed in 0.210303 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list