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[CASTEP/Dmol3/MS] DMol3中β-O-4在MgO催化剂上的过渡态计算耗时过长怎么优化?

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本帖最后由 科研好难 于 2023-10-15 13:27 编辑

各位好,我在DMol3中 计算β-O-4(木质素二聚体)在MgO催化剂团簇上的反应过渡态,我对催化剂下面两层进行了固定,并在96核的双路服务器上计算,最长的一次计算了8天都没有计算完(没有报错,外部原因手动停止了计算),想请问一下是不是结构或者设置有什么不合理的地方?还是说本来就需要很长的时间?结构和设置如下图:



202310151319004633..png (87.51 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

202310151319004633..png

202310151317555287..png (109.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

202310151317555287..png

202310151316052781..png (88.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

202310151316052781..png

202310151312563927..png (137.18 KB, 下载次数 Times of downloads: 21)

生成物结构如下

生成物结构如下

202310151311155817..png (207.98 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

反应物结构如下

反应物结构如下

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发表于 Post on 2023-10-15 16:21:25 | 只看该作者 Only view this author
我不用Dmol3,只是建议嫌慢就用免费而且巨快的CP2K,算这种体系在你这样配置的机子上顶多几个小时就完事,结合Multiwfn创建输入文件(《使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件》http://sobereva.com/587)又特别容易
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-16 15:38:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-15 16:21
我不用Dmol3,只是建议嫌慢就用免费而且巨快的CP2K,算这种体系在你这样配置的机子上顶多几个小时就完事, ...

好的,谢谢sob老师,我去了解一下CP2K

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