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[GROMACS] 用gromacs模拟十二烷表面张力低温出现问题

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用gromacs模拟十二烷表面张力,高温下数据可以,但是在75°以下模拟的数据是错的,这是什么原因

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发表于 Post on 2018-12-18 03:55:36 | 只看该作者 Only view this author
模拟结果好坏严重取决于力场,力场是比你用的程序关键得多得多的点,所以当前问题表述很不充分
除此以外能导致结果是错的因素也极多
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-18 10:46:36 | 只看该作者 Only view this author
使用gromacs进行分子动力学模拟,使用GTX1080TI单GPU设备可以吗?速度快不快? 如果使用更高的配置,要升级哪个部分?怎么升级

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发表于 Post on 2018-12-18 16:09:05 | 只看该作者 Only view this author
shanxitaiyuan 发表于 2018-12-18 10:46
使用gromacs进行分子动力学模拟,使用GTX1080TI单GPU设备可以吗?速度快不快? 如果使用更高的配置,要升级 ...

完全可以,速度已经很好了
也没什么再提升GPU的必要了。虽然现在有更猛的RTX2080Ti,但贵得离谱
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-19 10:23:49 | 只看该作者 Only view this author
我看了下您说的那个双GPU RTX2080Ti好像17000多,单GPU的也只有14000多,我提供的单GPU GXT1080Ti的是14000多。双的要21000多,这些型号的运算速度差的很多吗?双GPU有必要吗?

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发表于 Post on 2018-12-19 14:51:09 | 只看该作者 Only view this author
shanxitaiyuan 发表于 2018-12-19 10:23
我看了下您说的那个双GPU RTX2080Ti好像17000多,单GPU的也只有14000多,我提供的单GPU GXT1080Ti的是14000 ...

1080Ti目前只不过六千块钱而已
RTX2080Ti跑GPU加速的MD完全不划算,一比较和1080Ti的单精度性能和价格就知道
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-19 15:22:16 | 只看该作者 Only view this author
我这个是在京东上面看到的?您的这个价钱是哪里看到的?

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发表于 Post on 2018-12-19 18:59:52 | 只看该作者 Only view this author
shanxitaiyuan 发表于 2018-12-19 15:22
我这个是在京东上面看到的?您的这个价钱是哪里看到的?

你说的价格是整机吧
我说的是单块显卡
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-21 11:27:48 | 只看该作者 Only view this author
好的

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