求助：amber力场文件各项意义

wfmf1994 · 发表于 Post on 2019-1-9 16:26:49

我最近在学习amber，我想问下：1.amber的力场文件的具体每一项的意义是什么？
2.或者某种工具可以把gromacs的力场文件转换成amber的力场文件？
3.对于gromacs，可以在力场文件里用constraints对某个键长进行约束，对于amber应该怎么去做呢？

先谢过各位了

sobereva · 发表于 Post on 2019-1-9 22:04:00

1 看手册
2 没有。（如果是指拓扑文件转换，可以用https://atb.uq.edu.au/index.py?tab=topology_converter）

wfmf1994 · 发表于 Post on 2019-1-10 14:39:32

sobereva 发表于 2019-1-9 22:04
1 看手册
2 没有。（如果是指拓扑文件转换，可以用https://atb.uq.edu.au/index.py?tab=topology_converte ...

老师，amber手册里好像并没有类似于gromacs手册第三章那样介绍拓补文件的章节。在gromacs中，可以做到在拓补文件里用constraints对某个键进行约束，amber在手册里我好像没有找到这样的？

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