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[ORCA] 使用orca对单键连接的并五苯二聚体优化后存在虚频求助

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本帖最后由 hhhhhei 于 2023-6-13 20:57 编辑

使用orca,采用wB97X-D3泛函,6-31G*基组对用单键连接的并五苯二聚体(乙炔侧基)进行优化,发现总是存在一个很小的虚频,-3.33cm-1,想请教一下如何去掉这个虚频。orca版本5.0.1

分子结构:



优化的输入文件:
# avogadro generated ORCA input file
# Basic Mode
% pal nprocs 32 end
! wB97X-D3 6-31G* opt  

* xyz 0 1
C       -5.143430980      0.342477085     -1.262506136
C       -4.309728389     -0.377869675     -0.470556888
C       -2.884897623     -0.172419288     -0.519572590
C       -2.361898612      0.819634144     -1.428672707
C       -3.286704266      1.553956767     -2.252553655
C       -4.621969166      1.325027413     -2.173034474
C       -0.999966941      1.042443202     -1.480413031
C       -0.096095826      0.322786977     -0.665775483
C       -0.616581738     -0.678826768      0.230933987
C       -2.013679427     -0.892217694      0.274055576
C        0.273609530     -1.418809624      1.042733854
C        1.665204196     -1.176026610      1.000888530
C        2.182834661     -0.157934881      0.121130002
C        1.295322098      0.568250036     -0.704947263
C        3.573692314      0.093766161      0.116321026
C        4.443161526     -0.612799528      0.923685959
C        3.929162088     -1.652684172      1.780459077
C        2.572631515     -1.905984963      1.804269076
C        4.864199589     -2.387237100      2.592184415
C        6.188654156     -2.100735047      2.565510409
C        6.710711486     -1.042839562      1.732477427
C        5.852993185     -0.336489463      0.942997981
C        8.161211758     -0.729393348      1.753508119
C        9.107103528     -1.710307532      1.728325448
C       10.512176901     -1.403333636      1.729246922
C       10.918272057     -0.020613792      1.782672673
C        9.893470291      0.988962105      1.817745365
C        8.581956598      0.651875455      1.797385881
C       12.260794414      0.295846925      1.798870604
C       13.261443428     -0.701887344      1.746052572
C       12.858066102     -2.083268521      1.668293528
C       11.477354417     -2.389831675      1.670134077
C       13.844437865     -3.092817259      1.590132967
C       15.219956492     -2.765714496      1.591767618
C       15.621972214     -1.384891484      1.682489962
C       14.635645880     -0.375272847      1.760079266
C       17.001391349     -1.076983639      1.685276959
C       17.967292599     -2.059881242      1.597616953
C       17.565474689     -3.442449511      1.503441785
C       16.221367560     -3.760062558      1.504500098
C       18.589304980     -4.450642359      1.407147321
C       19.902851540     -4.110729866      1.405059348
C       20.302724731     -2.734005061      1.500839023
C       19.373372218     -1.749887056      1.593896040
C        1.811916981      1.567323448     -1.590743559
C        2.247705489      2.412653979     -2.336054502
C       -0.241943595     -2.422266635      1.924239034
C       -0.676003869     -3.271235392      2.666325228
C       15.035556056      0.996137193      1.852892440
C       15.376088370      2.152471681      1.930054078
C       13.444042870     -4.464187613      1.501493785
C       13.102051486     -5.620466475      1.430039607
H       -6.217105647      0.181858674     -1.214469081
H       -4.700530960     -1.122153991      0.219876546
H       -2.887554917      2.296471111     -2.939879632
H       -5.310073235      1.887446234     -2.798028980
H       -0.604165582      1.791625420     -2.160919419
H       -2.404673061     -1.641476544      0.957289940
H        3.960155578      0.869866077     -0.538475104
H        2.182113230     -2.681344085      2.457632247
H        4.481175007     -3.171033669      3.241069658
H        6.878572304     -2.647603647      3.202527876
H        6.227934037      0.449925867      0.291191087
H        8.812345527     -2.756302901      1.676532269
H       10.196786203      2.031767976      1.867898444
H        7.818170699      1.422963685      1.847494667
H       12.566807178      1.337154620      1.845653310
H       11.176379168     -3.432451330      1.620564580
H       17.301510381     -0.035135550      1.753569793
H       15.915730340     -4.800336989      1.435091028
H       18.282132038     -5.491213027      1.335353670
H       20.666579579     -4.879663096      1.327791619
H       21.360963770     -2.488468910      1.498176053
H       19.671259177     -0.706672248      1.665730903
H        2.640498327      3.142144183     -3.009904773
H       -1.067029223     -4.006099579      3.335246251
H       15.679890677      3.173090049      2.004674050
H       12.798083172     -6.641309263      1.359325968
*

频率的输入文件:


202306132039553297..png (71.73 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

分子结构

分子结构

202306132052284260..png (16.35 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

虚频

虚频

log

890.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

频率的输出文件

pentacenetwo.inp

3.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

频率的输入文件

pentacenetwo.inp

4.38 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

优化的输入文件

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发表于 Post on 2023-6-13 21:57:10 | 只看该作者 Only view this author
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2023-6-13 23:11:14 | 只看该作者 Only view this author
你用Avogadro生成ORCA输入文件?这个太不讲究了吧,基组、格点密度、收敛限、输出内容都有提高的必要。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-14 09:56:43 | 只看该作者 Only view this author
谢谢谢 谢谢

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发表于 Post on 2023-6-14 10:05:01 | 只看该作者 Only view this author
起码先带上tightSCF再说

解决思想和此文一致
Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法
http://sobereva.com/278http://bbs.keinsci.com/thread-633-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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