高斯09 溶剂化自由能非极性计算问题

xingyuan · 发表于 Post on 2019-4-11 10:37:08

本帖最后由 xingyuan 于 2019-4-11 10:37 编辑

各位老师好：

最近在使用高斯09软件计算溶剂化自由能，已经看了sob老师发的帖子，使用SMD模型 M052X/6-31G*的方法，但是结果并没有PCM模型好。但是在使用PCM模型的时候遇到了一些问题，就是我没有加Dis ，Rep，Cav关键词，但是在结果中显示了non-polar的部分，有的结果显示有的没有显示。我看manual默认是不计算非极性部分的，所以我想问一下各位老师这是为什么？其中我发现计算了non-polar的溶质都是普通的分子(CO2)，但是含有金属离子的溶质（EEACOO-Li)就不计算non-polar了,所以是因为离子的主要是静电力部分，所以这部分就不用考虑了吗，然后高斯09默认是计算非极性部分？两种情况的图如图所示。关键词用的是默认的，如下。望各位老师指教！
#p opt freq b3lyp/6-31++g(d,p) scrf=(solvent=dmso) geom=connectivity

sobereva · 发表于 Post on 2019-4-11 16:10:58

“结果并没有PCM模型好”纯属巧合
看SMD原文，从统计精度上看好得多

xingyuan · 发表于 Post on 2019-4-11 17:21:28

sobereva 发表于 2019-4-11 16:10
“结果并没有PCM模型好”纯属巧合
看SMD原文，从统计精度上看好得多

嗯嗯，是的。老师，我还有一个问题，计算离子的溶剂化自由能如果只用隐形溶剂模型，使用SMD模型计算，这个可以接受吗。

sobereva · 发表于 Post on 2019-4-11 17:23:31

xingyuan 发表于 2019-4-11 17:21
嗯嗯，是的。老师，我还有一个问题，计算离子的溶剂化自由能如果只用隐形溶剂模型，使用SMD模型计算，这 ...

可以

xingyuan · 发表于 Post on 2019-4-11 17:35:41

sobereva 发表于 2019-4-11 17:23
可以

好的，感谢老师。因为我看文献上面计算离子（Li+）在DMSO中的溶剂化自由能，都是在(Li+)周围放DMSO溶剂分子（4）个，然后再计算的。总感觉直接用隐形溶剂模型计算不太放心。

sobereva · 发表于 Post on 2019-4-11 17:50:35

xingyuan 发表于 2019-4-11 17:35
好的，感谢老师。因为我看文献上面计算离子（Li+）在DMSO中的溶剂化自由能，都是在(Li+)周围放DMSO溶剂分 ...

这种体系本来就应该用杂化溶剂模型，否则误差很大

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