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[GROMACS] 求助gromacs计算相互作用能得到的能量项的问题

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各位老师,同学们好,我想在gromacs中计算相互作用能,我在md.mdp中定义了两个能量组为SINF和DMSO。在rerun之后,提取了这四项能量:Coul-SR、LJ-SR、Coul-14、LJ-14。这四项能量均有具体的数值。想问的问题是1-4作用只存在于分子内,分子之间的1-4项应该为0啊。为啥我提取出来的1-4项不为0啊。以下是我提取能量值。希望各位大佬予以解答。感谢感谢。

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发表于 Post on 2024-6-22 02:12:58 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “gromacs计算相互作用能” 改了,以后务必注意!下次将删帖+扣分处理。
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