研究碱基对间质子转移， 校正后过渡态能量小于产物能量

Happypant

采用B3LYP/6-31+g(d,p)方法，用PCM模拟水环境，研究镁离子对腺嘌呤-胸腺嘧啶碱基对的质子转移的影响。最近整理数据，发现Sum of electronic and zero-point Energies的数值过渡态小于产物，无论是不加镁离子还是镁离子络合于三个供电子位后都是这样。产物正常输出，过渡态虚频振动也是在质子转移方向。不知道问题出在哪儿。附件是不加镁离子AT碱基对单质子转移的反应物、过渡态、产物的输出文件。请指教。

sobereva

电子能垒很小的时候，考虑ZPE后TS比相邻的极小点能量还低是很正常的事，本来TS就有一个虚频，对ZPE无贡献，因此ZPE通常比极小点小

Happypant

sobereva 发表于 2019-5-9 21:22
电子能垒很小的时候，考虑ZPE后TS比相邻的极小点能量还低是很正常的事，本来TS就有一个虚频，对ZPE无贡献， ...

好的，谢谢sob老师。