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[GROMACS] 如何判断nvt/npt是否平衡

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如题

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发表于 Post on 2020-2-2 05:47:46 | 只看该作者 Only view this author
普通问题提问前先搜论坛首页google框,诸如你应当搜“判断 平衡”。这种常见问题显然不可能搜不到。已有讨论中没有的再问,而且要问具体(最最起码说清楚什么程序算什么体系),否则别人得写很多字才能把所有可能性涵盖全面。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-2-10 10:57:45 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢sob老师
Gromacs跑离子液体动力学模拟中,关于看到“跑散”这个问题
对于这个跑散了,不清楚是什么意思。是分子跑出盒子吗?我使用周期性边界了,不会跑出去吧?
跑散是对团簇或者多个分子来说的吧,单个分子/离子,没有跑散这一说把
在别的帖子还提到了nvt/npt是否平衡如何判断。您提到大分子考察RMSD,其他一般考察密度,那离子液体我考察密度即可是吗?分子量只有几百,甚至更小.

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发表于 Post on 2020-2-13 17:49:48 | 只看该作者 Only view this author
a617788816 发表于 2020-2-10 10:57
好的,谢谢sob老师
Gromacs跑离子液体动力学模拟中,关于看到“跑散”这个问题
对于这个跑散了,不清楚是 ...

没语境没法说

考察密度、总能量变化就可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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