Multiwfn快乐更新小助手 MUA 3.0

winnerwill

“波函数分析程序Multiwfn（http://sobereva.com/multiwfn）如今已十分流行”，更重要的是，更新还极其频繁！
以往每次更新还是有点小烦的。所以为了偷懒，写了个小脚本，方便以后多次及时更新。

MUA 3.0 for Linux and Windows 二合一版本 MUA (28.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 314)

2021-3-24 09:45 上传 Uploaded

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2021/03/24

Multiwfn快乐更新小助手 MUA 3.0 升级【 Multiwfn Update Assistant All in One 】
【更新3.0】 2021/03/24

增加了-p选项，用于修改settings.ini中的指定参数或者显示所有参数。

1. mua -p ?
   
2. mua -p "isilent 0"
   
3. mua -p 'nthreads 12 iuserfunc 23'

复制代码

增加了-e选项，后面可以带输入文件路径，用于直接运行主程序。

1. mua -e ?
   
2. mua -e CP2K_diamond_2x2_DZVP-MOLOPT.inp

复制代码

增加了-i选项，用于增加[Atoms]前的指定内容。
增加了显示本地安装版本以来的更新历史显示。
完善了双系统的兼容性。
之前的版本不建议再使用。


Multiwfn快乐更新小助手 MUA 2.0 升级【 Multiwfn Update Assistant All in One 】
==============适用于Multiwfn更新小助手 （Multiwfn Update Assistant）MUA for Linux & Windows All-in-One 2.0版本=========================
初次使用步骤：
1. 下载脚本
2. cd进入脚本所在目录，执行 bash ./MUA （只设置参数）或者 bash ./MUA -d1 -w （会下载最新版本）
3.  退出terminal重新登录或者直接 source  ~/.bashrc
更新完毕。

备注：
使用前，可选修改脚本中图1中所示偏好设置。主要是指定解压软件，默认的是unzip和7z。
不要求设置平台系统环境变量。不设则脚本会自行确定。
无需指定平台系统，系统默认会自行识别。
这些修改在同一台电脑上只需指定一次。也可以通过命令行参数来指定。
适用于Multiwfn的Linux版本和Windows版本升级。
Windows下只要有terminal（如MobaXterm,cmder等）能执行Linux命令即可。
特别说明：针对Windows下解压缩rar文件，其实不需要额外安装解压软件，Windows下正常能解压rar文件的程序如7-Zip就行，只要建立软连接到terminal就能直接使用。
以7-Zip（假设安装在C:\Program Files\7-Zip\）为例，在terminal执行以下命令，就可以在terminal和脚本中直接用7z指令了：

1. ln -s "C:\Program Files\7-Zip\7z.exe" /usr/bin/7z

复制代码

然后就可以用 7z x <foo.rar>进行解压了。
（更新了脚本图2）


After downloading the script, execute the following commands :

1. >>Usage: cd  <path-to-MUA>
   
2. >>Usage: bash ./MUA （Only default setting）或者 bash ./MUA -d1 -w （Update to the latest version of Multiwfn as well）
   
3. >>Usage: source ~/.bashrc

复制代码

现在可以使用Alias 来说进行操作了。


日常用法说明：
>>Usage: mua [ options ]
>>Usage: options: [ -n nthreads | -s ompstacksize | -m  Multiwfnpath | -d dlname | -o ORCA_EXEDIR | -g GAUSS_EXEDIR | -r USERROOT | -S OperatingSystem | -Z UnZipCommand  | -M  | -l  | -U | -c | -w | -h ]

常用指令示例：

1. mua                                #设置
   
2. mua -h                          #显示帮助信息
   
3. mua -c                          #检查最新版本
   
4. mua -d1                         #更新最新版本
   
5. mua -SL                         #指定Linux平台
   
6. mua -SW                         #指定Windows平台
   
7. mua -M                          #下载最新用户手册
   
8. mua -U                          #清除.bashrc信息
   
9. mua -L                          #列出在线资源

复制代码

后面是更新历史：
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【发布 Multiwfn更新小助手 MUA 2.0版（Multiwfn Update Assistant）Linux & Windows in One 】 2020/10/31
在Linux版本上增加了支持Windows版Multiwfn的更新，只需要一个脚本就可以了。
对任意Multiwfn版本以及所有PDF文档的下载支持进行了完善。支持新旧版本的Multiwfn和用户手册的下载。默认为最新版本下载。
通过-d选项下载程序文件及文档。
增加了-l选项，列出可下载的在线资源。
增加了-M选项，下载最新版本的用户手册。其他版本的用户手册由-d选项完成。
增加了-S选项，指定操作系统，如无指定，则脚本会自行判断系统。
增加了-Z选项，指定解压程序或指令。
增加了-u选项，用于清除.bashrc文件Multiwfn相关环境变量设置。
完善了-h信息，给出常用指令用法。
如需用-g，-o，-m，-r等选项来指定路径，路径有空格时只需用引号就行，其他与Linux和Windows下使用习惯一致即可，无需转义。

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【更新1.1】 2020/10/29
增加了-w选项，这个选项不带参数（“小白”选项）。会自行检测用户是否本脚本或者Multiwfn的新用户，会根据判断结果写入环境变量。适合第一次使用时使用（后续更新基本无需再用到）。
bash ./config_Multiwfn_settings.sh -d 1 -w
（第一次使用只需把脚本下载，terminal进入脚本所在文件夹位置，然后复制以上蓝色命令执行即可完成）
增加了-c选项，用于版本检测（受到隔壁大佬@ene 的启发）
增加了一个alias（见后文），第一次使用本脚本后退出terminal重新登录或者直接 source  ~/.bashrc后生效。以后使用只要使用alias就很方便了。
完善了 -d 选项， 默认获取在线最新版本号，也可以直接输入任意版本号获取相应版本。
PS： 原来有两个选项，其中-n用来自行指定线程数，-s用来自行指定KMP_STACKSIZE变量值，正常不需要用到。



默认神奇咒语是： sob


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【发布针对Win版Multiwfn的脚本】 2020/10/29
Windows下用得不多，可以跳过。大多数时候还是用Linux的版本。仅供参考。
新增了一个在Windows更新Multiwfn和设置配置文件的试用版，目前在MobaXterm测试可用，包括下载，检测版本及设置参数，得到的Multiwfn.exe也在MobaXterm可用。
设置参数方面涉及斜杠反斜杠区别，以下指令可用：
bash ./config_Multiwfn_settingsWin.sh -d 1
bash ./config_Multiwfn_settingsWin.sh -d 1 -w -g 'C:\\G16W\\' -o 'C:\\orca new\\' -n 2 -s 200000000
bash ./config_Multiwfn_settingsWin.sh -w -g 'C:\\G16W\\' -o 'C:\\orca new\\' -n 2 -s 200000000
bash ./config_Multiwfn_settingsWin.sh -c
source 后就可以使用alias了：
如：sobWin -c
我没用Windows版的ORCA，示例中的路径仅供参考。
针对Windows的这个版本可以用 -o  -g  -n -s 等参数来设定或者手动设置配置文件参数。
注意如果要使用Windows下的路径的不同，见上面示例。也可以转换成Linux格式的路径，但必须是MobaXterm等可认的。
对于这个版本，里面有用到解压rar文件的程序，需要根据自己的情况修改解压程序路径。


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【发布1.0】 2020/10/28
需要更换版本时可以尝试以下指令，将会下载Multiwfn并更新settings.ini文件设置：
./config_Multiwfn_settings.sh -d 1
发现服务器的带宽对于下载相比于本地下载还要来得快很多！


如果手动下载替换，只需更新settings.ini文件，则使用其他参数进行设置。
-g 后面带的是Gaussian程序安装目录
-o 后面带的是ORCA程序安装目录
-m带的是Multiwfn程序安装目录
-r带的是目录为以上程序共同路径部分（如有），用这个选项时可以替换相应的以上选项。
如： ./config_Multiwfn_settings.sh -r ~
这些选项也可以与-d选项同时使用。
-d 带的是官网安装程序的Zip文件名，或者1代表默认文件名。

也可以不带选项使用默认参数来自动更新。
./config_Multiwfn_settings.sh

./config_Multiwfn_settings.sh -h 获取帮助信息。
以上安装更新成功会输出相应成功的信息。注意double check下最后输出的参数信息是否合适。如有错误提示则需提供相应选项正确值。
注意成功安装后，如有旧的Multiwfn会备份成Multiwfn-old，自行确认保留或删除。
Linux 1.0版本 config_Multiwfn_settings.sh (4.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 38)

2020-10-28 08:32 上传 Uploaded

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2020/10/28 Version: 1.0
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Linux 1.1版本 config_Multiwfn_settings.sh (9.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 46)

2020-10-29 23:41 上传 Uploaded

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2020/10/29 Version: 1.1
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Win版 config_Multiwfn_settingsWin.sh (10.14 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

2020-10-29 22:50 上传 Uploaded

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2020/10/29 Win 版 Version: 1.0
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MUA 2.0 for Linux and Windows 二合一版本 MUA (18.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 27)

2020-11-1 17:10 上传 Uploaded

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2020/10/31 All-in-One Version 2.0
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最后谢谢社长这么勤快更新，造福广大用户。

冰释之川

终于可以省去用notepad++对比新旧配置文件的糟心过程了

winnerwill

冰释之川 发表于 2020-10-28 09:27
终于可以省去用notepad++对比新旧配置文件的糟心过程了

确实是写这个脚本的最根本原因。。。
主要是社长太勤快了。。。
写完之后发现，以后再也不怕社长频繁更新了。
特别是比下载到本地再传上服务器省事快捷。
现在再定义一个alias，每次只需打几个字母，就完成Multiwfn下载、安装、更新的自动完成。

PS. 上面给出的第一个指令最适合第一次使用Multiwfn的用户使用。
后面如果有需要，可以加一个往.bashrc写入环境变量的操作。

ggdh

冰释之川 发表于 2020-10-28 09:27
终于可以省去用notepad++对比新旧配置文件的糟心过程了

请问为啥要对比新旧配置文件啊？难道每次更新，都不能兼容旧版的配置文件？

winnerwill

ggdh 发表于 2020-10-28 20:04
请问为啥要对比新旧配置文件啊？难道每次更新，都不能兼容旧版的配置文件？

有时兼容，毕竟Multiwfn有时会增减参数。最后的配置文件还是基于原装配置文件修改的。如以后有其他参数也需要修改，可以照葫芦画瓢增减。

冰释之川

ggdh 发表于 2020-10-28 20:04
请问为啥要对比新旧配置文件啊？难道每次更新，都不能兼容旧版的配置文件？

方便改参数啊，还有就是万一某个新版本里的配置文件取消/新加入了某个参数，可以及时发现

冰释之川

碰到了一件怪事……



脚本里加了一句代码搞定了

1. [[ -f "${ORCA_EXEDIR}" ]] || ORCA_EXEDIR=$(dirname $(which orca 2>/dev/null))

复制代码

winnerwill

冰释之川 发表于 2020-10-29 09:25
碰到了一件怪事……

确实有点怪，ORCA默认的安装是都在同一个目录下的。 估计你把安装ORCA时把执行文件orca跟orca_2mkl分开放了。
应该只需要把原来的 [[ -d "${ORCA_EXEDIR}" ]] 改成 [[ -f "${ORCA_EXEDIR}/orca_2mkl" ]]就行了。

winnerwill

【更新1.1】 2020/10/29
增加了-w选项，这个选项不带参数（“小白”选项）。会自行检测用户是否本脚本或者Multiwfn的新用户，会根据判断结果写入环境变量。适合第一次使用时使用（后续更新基本无需再用到）。
增加了-c选项，用于版本检测（受到隔壁大佬的启发）
增加了一个alias，第一次使用本脚本后退出terminal重新登录或者直接 source  ~/.bashrc后生效。以后使用只要使用alias就很方便了。
完善了 -d 选项， 默认获取在线最新版本号，也可以直接输入任意版本号获取相应版本。
PS： 原来有两个选项，其中-n用来自行指定线程数，-s用来自行指定KMP_STACKSIZE变量值，正常不需要用到。

winnerwill

冰释之川 发表于 2020-10-29 09:25
碰到了一件怪事……

新版本里也改进了，以适应这种情形。

冰释之川

winnerwill 发表于 2020-10-29 19:02
新版本里也改进了，以适应这种情形。

大佬考虑再搞个更新windows版Multiwfn程序的脚本不？

winnerwill

冰释之川 发表于 2020-10-29 19:59
大佬考虑再搞个更新windows版Multiwfn程序的脚本不？

加了个针对win版Multiwfn的初级脚本。在cmder下可以试试。

不搞批处理了。用的真不多。

winnerwill

【发布 Multiwfn更新小助手 MUA 2.0版（Multiwfn Update Assistant）Linux & Windows in One 】 2020/10/31
在Linux版本上增加了支持Windows版Multiwfn的更新，只需要一个脚本就可以了。
对任意Multiwfn版本以及所有PDF文档的下载支持进行了完善。支持新旧版本的Multiwfn和用户手册的下载。默认为最新版本下载。
通过-d选项下载程序文件及文档。
增加了-l选项，列出可下载的在线资源。
增加了-M选项，现在最新版本的用户手册。其他版本的用户手册由-d选项完成。
增加了-S选项，指定操作系统，如无指定，则脚本会自行判断系统。
增加了-Z选项，指定解压程序或指令。
增加了-u选项，用于清除.bashrc文件Multiwfn相关环境变量设置。
完善了-h信息，给出常用指令用法。
如需用-g，-o，-m，-r等选项来指定路径，路径有空格时只需用引号就行，其他与Linux和Windows下使用习惯一致即可，无需转义。

winnerwill

升级为二合一版本MUA 2.0：
==============适用于Multiwfn更新小助手 （Multiwfn Update Assistant）MUA for Linux & Windows All-in-One 2.0版本=========================
初次使用步骤：
1. 下载脚本
2. cd进入脚本所在目录，执行 bash ./MUA （只设置参数）或者 bash ./MUA -d1 -w （会下载最新版本）
3.  退出terminal重新登录或者直接 source  ~/.bashrc
更新完毕。

备注：
使用前，可选修改脚本中图1中所示偏好设置。主要是指定解压软件，默认的是unzip和7z。不要求设置平台系统环境变量。不设则脚本会自行确定。
无需指定平台系统，系统默认会自行识别。
这些修改在同一台电脑上只需指定一次。也可以通过命令行参数来指定。
适用于Multiwfn的Linux版本和Windows版本升级。
Windows下只要有terminal（如MobaXterm,cmder等）能执行Linux命令即可。

After downloading the script, execute the following commands :

• >>Usage: cd  <path-to-MUA>
• >>Usage: bash ./MUA （Only default setting）或者 bash ./MUA -d1 -w （Update to the latest version of Multiwfn as well）
• >>Usage: source ~/.bashrc
  

[color=rgb(51, 102, 153) !important]复制代码
现在可以使用Alias 来说进行操作了。


日常用法说明：
>>Usage: mua [ options ]
>>Usage: options: [ -n nthreads | -s ompstacksize | -m  Multiwfnpath | -d dlname | -o ORCA_EXEDIR | -g GAUSS_EXEDIR | -r USERROOT | -S OperatingSystem | -Z UnZipCommand  | -M  | -l  | -U | -c | -w | -h ]

常用指令示例：

• mua                                #设置
• mua -h                          #显示帮助信息
• mua -c                          #检查最新版本
• mua -d1                         #更新最新版本
• mua -SL                         #指定Linux平台
• mua -SW                         #指定Windows平台
• mua -M                          #下载最新用户手册
• mua -U                          #清除.bashrc信息
• mua -L                          #列出在线资源
  

winnerwill

特别说明：针对Windows下解压缩rar文件，其实不需要额外安装解压软件，Windows正常能解压rar文件的程序如7-Zip就行，只要建立软连接到terminal就能直接使用。
以7-Zip（假设安装在C:\Program Files\7-Zip\）为例，在terminal执行以下命令，就可以在terminal和脚本中直接用7z指令了：
ln -s "C:\Program Files\7-Zip\7z.exe" /usr/bin/7z

然后就可以用 7z x <foo.rar>进行解压了。
（更新了脚本）