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[ORCA] orca计算单点用Bq原子出问题

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楼主
想要计算键能
在结构的基础上添加了Bq
用orca算
输入文件
! DLPNO-CCSD(T) normalPNO RIJK aug-cc-pVTZ aug-cc-pVTZ/JK aug-cc-pVTZ/C tightSCF noautostart miniprint nopop
%maxcore  1000
%pal nprocs   4 end
%cpcm
smd true
SMDsolvent "water"
end
* xyz  -1   1
C     -0.18707100   -0.29653800    0.02030000
C      1.07041900    0.58008100    0.18924900
S      2.67154800   -0.31850400   -0.04427400
O      3.63793200    0.63242100    0.47947400
O      2.49723000   -1.52176900    0.75412600
O      2.74696700   -0.53555800   -1.47889100
F     -0.04704600   -1.11237000   -1.03272000
F     -1.49235400    1.04638800   -1.41940600
F     -0.36384800   -1.03433000    1.12300500
F      1.01060900    1.59384700   -0.69387200
F     -1.54759500    1.51034600    0.68956800
F      1.04611100    1.10215400    1.42597600
F     -2.53286500   -0.25666200   -0.05800000
Bq    -1.47400500    0.52826000   -0.20078800
*

输出文件
Your calculation uses the libint2 library for the computation of 2-el integrals
For citations please refer to: http://libint.valeyev.net


Your ORCA version has been built with support for libXC version: 5.1.0
For citations please refer to: https://tddft.org/programs/libxc/


This ORCA versions uses:
   CBLAS   interface :  Fast vector & matrix operations
   LAPACKE interface :  Fast linear algebra routines
   Shared memory     :  Shared parallel matrices




[file orca_main/maininp2.cpp, line 257]: Element name/number, dummy atom or point charge expected in COORDS ATOM-NO 14



请教各位老师
为什么ORCA报错,需要怎么修改呢
是不是我的Bq原子设置的有问题
能明白是Bq原子出的问题
不知道如何解决
要是想计算键能我用Bq更好还是X更好呢

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发表于 Post on 2023-6-12 15:42:10 | 只看该作者 Only view this author
不要自己发明写法
只有在高斯里,ghost atom才叫Bq。orca里的写法自己在手册里搜ghost查
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-12 19:44:11 | 只看该作者 Only view this author
好的谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-12 20:26:13 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-6-12 15:42
不要自己发明写法
只有在高斯里,ghost atom才叫Bq。orca里的写法自己在手册里搜ghost查

我找一下orca的手册没有找到,请问我应该到哪里去下载呢,谢谢

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发表于 Post on 2023-6-12 20:43:36 | 只看该作者 Only view this author
桃子量子 发表于 2023-6-12 13:26
我找一下orca的手册没有找到,请问我应该到哪里去下载呢,谢谢

在orca论坛的下载区下载,论坛链接见我签名档
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-12 22:10:30 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-6-12 20:43
在orca论坛的下载区下载,论坛链接见我签名档

好的谢谢您

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发表于 Post on 2023-6-13 12:27:05 | 只看该作者 Only view this author
算键能和用Bq没有直接关系

如果你是想做counterpoise,对于计算化学键键能可能有害
计算化学键键能时考虑BSSE不仅是多余的甚至是有害的
http://sobereva.com/381http://bbs.keinsci.com/thread-6047-1-1.html

ORCA做counterpoise有省事的办法
在ORCA中做counterpoise校正并计算分子间结合能的例子
http://sobereva.com/542http://bbs.keinsci.com/thread-16585-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-13 15:42:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-13 12:27
算键能和用Bq没有直接关系

如果你是想做counterpoise,对于计算化学键键能可能有害

老师我翻看了orca的手册,查找了空原子和虚原子的区别,选择了dummy atom 空原子来算键能,这样的话可以吗,

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-13 16:23:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-13 12:27
算键能和用Bq没有直接关系

如果你是想做counterpoise,对于计算化学键键能可能有害

老师如果计算AB的键能,我分别计算A    B两个片段的能量和AB的能量,就可以算出AB的键能

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发表于 Post on 2023-6-13 17:07:07 | 只看该作者 Only view this author
桃子量子 发表于 2023-6-13 09:23
老师如果计算AB的键能,我分别计算A    B两个片段的能量和AB的能量,就可以算出AB的键能


一定要校正BSSE的话,建议用gCP方法,不受counterpoise方法不适合算共价键键能的限制。或者(仅限于DLPNO-CCSD(T)等波函数方法)用F12校正,既校正了HF的基组误差又校正了相关能的基组误差
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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