计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2308|回复 Reply: 11
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 在溶剂体系下是否要考虑阳离子的水合效应?

[复制链接 Copy URL]

113

帖子

0

威望

258

eV
积分
371

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
Lu老师和各位小伙伴们:
       你们好!
       Na+/Mg2+/Ca2+在水中需要把它们考虑成水合离子吗?通过看文献,我发现有的文献考虑成水合离子,有的文献没有考虑水合效应直接就是裸Na+/Mg2+/Ca2+(这个文献还是我们水处理领域的龙头老大Water Research期刊)。所以我现在就是来到了一个十字路口,想听听你们的声音。
       谢谢!

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
supplyinform + 3

查看全部评分 View all ratings

轻舟一过万重山。

1016

帖子

0

威望

2096

eV
积分
3112

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

2#
发表于 Post on 2022-6-13 10:21:21 | 只看该作者 Only view this author
要。原因是这些小离子与水分子的相互作用太强,溶剂模型不好处理。要用显式-隐式溶剂模型处理。即将这些小离子包上几个水分子(“考虑成水合离子”),再加隐式溶剂模型。
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算 http://sobereva.com/327
注意看(8)关于单原子离子的溶剂自由能计算

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
ReviewReview + 4 精品内容

查看全部评分 View all ratings

ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

113

帖子

0

威望

258

eV
积分
371

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-13 10:33:10 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-6-13 10:21
要。原因是这些小离子与水分子的相互作用太强,溶剂模型不好处理。要用显式-隐式溶剂模型处理。即将这些小 ...

哦哦谢谢老师。我计算的是Na+/Mg2+/Ca2+存在下A和B的吸附能,也要考虑离子的水合效应吗?
轻舟一过万重山。

1016

帖子

0

威望

2096

eV
积分
3112

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

4#
发表于 Post on 2022-6-13 13:29:24 | 只看该作者 Only view this author
ReviewReview 发表于 2022-6-13 10:33
哦哦谢谢老师。我计算的是Na+/Mg2+/Ca2+存在下A和B的吸附能,也要考虑离子的水合效应吗?

一般这种小离子在溶液中反应,都要考虑水合离子。不知你的体系中离子如何影响吸附,是离子与某个反应物结合后再吸附吗?

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
ReviewReview + 4 精品内容

查看全部评分 View all ratings

ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

113

帖子

0

威望

258

eV
积分
371

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-13 21:41:13 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-6-13 13:29
一般这种小离子在溶液中反应,都要考虑水合离子。不知你的体系中离子如何影响吸附,是离子与某个反应物结 ...

是的老师,我是先比较阳离子-A结合物的吸附自由能和阳离子-B结合物的吸附自由能,看哪个结合物在热力学上稳定,假如阳离子-A结合物在热力学上稳定那么就选择阳离子-A结合物作为一个整体再去与B附,然后用阳离子-A-B整体的单点能减去阳离子-A结合物的单点能再减去B的单点能,最后得出的差值就是Ca2+存在下A和B的吸附能。
现在依您的判断,是不是还是得考虑溶液中阳离子的水合效应?
轻舟一过万重山。

1016

帖子

0

威望

2096

eV
积分
3112

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

6#
发表于 Post on 2022-6-13 21:59:08 | 只看该作者 Only view this author
ReviewReview 发表于 2022-6-13 21:41
是的老师,我是先比较阳离子-A结合物的吸附自由能和阳离子-B结合物的吸附自由能,看哪个结合物在热力学上 ...

如果你的阳离子-A结合物足够大,并且能够把电荷分散开来,只用隐式溶剂模型也可以,不过一般误差会比电中性分子大,你要误差小一点,就加几个水分子再用隐式溶剂模型。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
ReviewReview + 4 精品内容

查看全部评分 View all ratings

ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

113

帖子

0

威望

258

eV
积分
371

Level 3 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-13 22:43:35 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ReviewReview 于 2022-6-13 22:44 编辑
chands 发表于 2022-6-13 21:59
如果你的阳离子-A结合物足够大,并且能够把电荷分散开来,只用隐式溶剂模型也可以,不过一般误差会比电中 ...

哦哦谢谢老师。我的A是6个单元的PVDF分子,其实也算大了吧?不过按您的意思,我为了追求更小的误差决定考虑离子的水合效应。对于Ca2+我看文献里用的是6水合Ca2+;对于Na+我没看到相关文献。请问怎么知道某个阳离子会结合几个水分子呢?
轻舟一过万重山。

1016

帖子

0

威望

2096

eV
积分
3112

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

8#
发表于 Post on 2022-6-14 09:22:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 chands 于 2022-6-14 09:30 编辑
ReviewReview 发表于 2022-6-13 22:43
哦哦谢谢老师。我的A是6个单元的PVDF分子,其实也算大了吧?不过按您的意思,我为了追求更小的误差决定考 ...

一般认为Na+的第一溶剂化层有5个水分子,查文献用关键词Na+ solvation。还有Na+,Ca2+的溶解自由能的数据我记得文献里是有的,可以直接用。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

113

帖子

0

威望

258

eV
积分
371

Level 3 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-14 09:28:03 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-6-14 09:22
一般认为Na+的第一溶剂化层有5个水分子,查文献用关键词Na+ solvation。Na+,Ca2+溶解自由能的数据我记得 ...

哦哦,不好意思啊老师,记住啦,我这就自己去查。
轻舟一过万重山。

113

帖子

0

威望

258

eV
积分
371

Level 3 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-14 18:08:19 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ReviewReview 于 2022-6-14 18:11 编辑
chands 发表于 2022-6-14 09:22
一般认为Na+的第一溶剂化层有5个水分子,查文献用关键词Na+ solvation。还有Na+,Ca2+的溶解自由能的数据 ...

老师,我刚刚查了7篇关于Na+水合数的文献(均放在了附件里供您查阅);其中有2篇文献的Na+第一溶剂层水合数是5.2,有1篇文献的Na+第一溶剂层水合数为5.5,有2篇文献的Na+第一溶剂层水合数是6,有1篇文献的Na+第一溶剂层水合数是8,有1篇文献说当H2O总数为1-12时Na+第一溶剂层水合数为4当H2O总数为13-20时Na+第一溶剂层水合数为6。这个就有些纠结了,我该选5还是6呢?由于我查的四篇关于Ca2+水合数的文献,四篇文献中的Ca2+水合数都是6。我就在想为了保持统一,我的Na+水合数能不能就选个6?

N=1-12时n=4; N=13-20时n=6.pdf

957.95 KB, 下载次数 Times of downloads: 9

n=5.2(1).pdf

272.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

n=5.2(2).pdf

849.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

n=5.5.pdf

3.01 MB, 下载次数 Times of downloads: 1

n=6(1).pdf

257.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

n=6(2).pdf

618.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

n=8.pdf

1.97 MB, 下载次数 Times of downloads: 1

轻舟一过万重山。

1016

帖子

0

威望

2096

eV
积分
3112

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

11#
发表于 Post on 2022-6-14 18:40:27 | 只看该作者 Only view this author
ReviewReview 发表于 2022-6-14 18:08
老师,我刚刚查了7篇关于Na+水合数的文献(均放在了附件里供您查阅);其中有2篇文献的Na+第一溶剂层水合 ...

不会影响太大,你会发现,加第一个水影响很大,后面的水影响就慢慢小了。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

113

帖子

0

威望

258

eV
积分
371

Level 3 能力者

12#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-14 18:53:06 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-6-14 18:40
不会影响太大,你会发现,加第一个水影响很大,后面的水影响就慢慢小了。

嗯嗯记住啦老师。主要得有文献依据嘛,不能按自己的主观臆想乱加,看来我给Na+加6个水合可以哈~
轻舟一过万重山。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-16 15:09 , Processed in 0.264840 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list