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[ORCA] PBS提交ORCA任务,跑完SCF后报错

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请教一下各位前辈,我用ORCA测试Sob老师的例子,用20个cpu可以正常运行,但是跑完38个cycle后SCF收敛了之后,就开始报错了。错误信息如下: 945   0.0000    3501.990545     95294.0074
946   0.0000    8364.504295    227609.7333
947   0.0000   17414.967090    473885.3464
948   0.0000   39305.736342   1069563.4614
Total SCF time: 0 days 1 hours 0 min 18 sec

ORCA finished by error termination in CIS
Calling Command: /home/svu/chmqinx/orca_4_1_2_linux_x86-64_openmpi313/orca_cis test.cisinp.tmp
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
  .... aborting the run

我用的例子是Sob老师的一个例子,这里我去掉了CPU的指定,因为我是用PBS脚本交任务,如果不去掉就不能正常运行。请问各位高手,有没有遇到过类似的错误呢?谢谢。


! B3LYP/G DKH2 DKH-def2-TZVP SARC/J RIJCOSX cpcm(CH2Cl2) tightSCF miniprint grid4 gridx4
%basis
NewGTO Os "SARC-DKH-TZVP" end
end
#%pal nprocs 36 end
#%maxcore 2500
%tddft nroots=10 TDA false dosoc true printlevel 3 end
* xyz 0 1
Os                -0.48653900   -1.13111300   -0.00057100
C                 -1.70360600   -1.70336600    1.36981900
O                 -2.40624700   -2.03132800    2.21274500
C                 -1.70363800   -1.70170800   -1.37170600
O                 -2.40617100   -2.02864000   -2.21511300
C                  0.44121900   -2.82167400   -0.00156900
O                  1.00937300   -3.81693000   -0.00191900
O                 -1.19650300    0.83746000    0.00100000
C                 -2.46443600    1.10203800    0.00070300
O                 -3.40320600    0.32006400   -0.00038500
C                 -2.71138800    2.63070500    0.00183100
F                 -4.02003900    2.91503300    0.00275700
F                 -2.15713300    3.19883900    1.09148300
F                 -2.15841500    3.20006600   -1.08791800
C                  2.34391500    0.81097600    0.00025700
H                  3.20802700    1.45758300    0.00056600
C                  1.81861200    0.40688800    1.22806600
C                  1.81826800    0.40848300   -1.22794200
O                  0.81827500   -0.34017500    1.46254800
O                  0.81789500   -0.33825700   -1.46311100
C                  2.50017100    0.87452900    2.52536600
C                  2.49956800    0.87772400   -2.52479600
F                  1.60624200    1.49722500   -3.31252600
F                  3.51604500    1.72435900   -2.29364300
F                  2.98165100   -0.18506400   -3.19332700
F                  1.60706300    1.49305100    3.31410000
F                  3.51664000    1.72139900    2.29512200
F                  2.98233300   -0.18914600    3.19245900
end



提交任务所用的脚本:
#!/bin/bash

#PBS -P Project_Name_of_Job
#PBS -j oe
#PBS -N orca

#PBS -q parallel20
#PBS -l select=1:ncpus=20:mpiprocs=20:mem=20GB

source /etc/profile.d/rec_modules.sh
module load xe_2015
#module load openmpi_3.1.3

export PATH=/app1/centos6.3/gnu/openmpi-3.1.3/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/app1/centos6.3/gnu/openmpi-3.1.3/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/svu/chmqinx/orca_4_1_2_linux_x86-64_openmpi313:$LD_LIBRARY_PATH

export orcadir=/home/svu/chmqinx/orca_4_1_2_linux_x86-64_openmpi313
export PATH=$orcadir:$PATH

cd $PBS_O_WORKDIR

#mpirun -np 20 -f ${PBS_NODEFILE}  /home/svu/chmqinx/orca_4_1_2_linux_x86-64_openmpi313/orca test.inp > out

$orcadir/orca test.inp > out






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发表于 Post on 2019-7-7 19:19:53 | 只看该作者 Only view this author
PBS的事我不清楚,但至少你得指定maxcore。给的内存量不够在多组态方法计算过程时很容易出错
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-8 15:01:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-7 19:19
PBS的事我不清楚,但至少你得指定maxcore。给的内存量不够在多组态方法计算过程时很容易出错

谢谢Sob老师的建议。我把内存扩大到了100Gb。但是还是同样的错误。错误文件里面显示是没有这个orca_cis这个文件,然后我去我放orca的文件里面,果然没有orca_cis,但是有orca_ciprep, orca_cipsi, orca_cipsi_mpi。我在想是不是解压之后丢失了什么文件。我去下载orca4.1.1来试试。
[chmqinx@atlas9-c01 test]$ more orca.o1103194
sh: /home/svu/chmqinx/orca_4_1_2_linux_x86-64_openmpi313/orca_cis: No such file or directory
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
  .... aborting the run

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