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[ORCA] 求助:ORCA计算卡住,警告信息“a second arrayIndex is passed”,结果还可用吗?

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本帖最后由 dnlx 于 2022-6-15 20:34 编辑

ORCA 5.0.1,在Windows 11上,体系是乙烷在石墨烯上的吸附(比社长的石墨烯少了一圈),在Iterative Optimization过程中,出现这样信息:

Warning: Variable with the name MODES is not a 2D-Array but a second arrayIndex is passed

然后程序就卡在那里了(卡住的原因不太可能是因为我输入文件存在问题)。输出文件已经消除了虚频,并且得到了自由能。请问这样的结果(优化后的结构和计算的自由能),是否可以使用?输入输出文件在附件。这种情况遇到了两次。
多谢各位指教!
C2H6_graphene.zip (257.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)




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发表于 Post on 2022-6-15 20:35:52 | 只看该作者 Only view this author
虚频并没有消掉。注意即使有虚频,THERMOCHEMISTRY AT 423.15K那里是不显示虚频的,需要到VIBRATIONAL FREQUENCIES那里看。更简单的方法是在整个输出文件里搜索imag。
这个可能是程序的bug,5.0.2开始修复了compound job的一些bug,可以试试下载最新版orca(5.0.3)看看

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dnlx + 5 多谢指出虚频!我去更新5.0.3。

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Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-16 06:42:34 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-15 20:35
虚频并没有消掉。注意即使有虚频,THERMOCHEMISTRY AT 423.15K那里是不显示虚频的,需要到VIBRATIONAL FREQ ...

升级到5.0.3,还是同样的问题。现在用compound job来消虚频走不通,只好手调撞运气了。

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发表于 Post on 2022-6-16 09:36:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 chrinide 于 2022-6-16 09:38 编辑

其实得恭喜你 找到一个过渡态

Lowest eigenvalues of augmented Hessian:
-0.000000077  0.000291379  0.002111312  0.003506927  0.005847816

FINAL ENERGY EVALUATION AT THE STATIONARY POINT

ORCA已经告诉你了,你找到了一个 STATIONARY POINT
可以把“石墨烯”固定住,做个构象搜索, 再算。全构象搜索太昂贵了

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dnlx + 5 哈哈

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发表于 Post on 2022-6-16 13:58:35 | 只看该作者 Only view this author
dnlx 发表于 2022-6-15 23:42
升级到5.0.3,还是同样的问题。现在用compound job来消虚频走不通,只好手调撞运气了。

另外也可以试一下linux版,我有模糊的印象好像compound job在windows上有一些问题
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-18 05:43:19 | 只看该作者 Only view this author
网格改成defgrid3就消掉了虚频(谢谢四楼指出有虚频的是过渡态)。出现了好多次内存不足的警告,但是好歹没崩掉。

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