lammps的data文件中键角参数为0

xulisky · 发表于 Post on 2015-8-16 09:47:36

根据大侠们以及手册及软件中的readme信息，通过MS建模之后，导出XXX.car文件。
之后通过lammps的mis2lmp工具进行转换。
然后一直提示找不到某些键、角参数，选择忽略之后，有输出文件XXX.data.
但是data文件中那些键、角的信息都显示的是0
而我觉得这几个键、角还挺重要的，大家一般去哪里找参数呢？

guo7212c · 发表于 Post on 2015-8-16 11:38:29

本帖最后由 guo7212c 于 2015-8-16 11:43 编辑

自认为，MD最繁琐最漫长的就是寻找合适于自己体系的力场，没有普适的力场，只有合适的，每个人用的力场都会有不同，有时甚至是研究体系的不同性质时用到的力场参数也会有不同。平衡键长或键角以及对应的弹力常数以及LJ势能参数的寻找过程，怎样才能找到适合于自己体系的力场，建议你看几篇做MD的博士论文，大都会叙述自己力场的寻找过程以及相关参考文献。书籍，强烈推荐陈正隆的《分子模拟的理论与实践》

看了下你的帖子，原来你是做离子液体的量化和MD的，推荐北化的刘志平组，中科院的张锁江是大牛。

xulisky · 发表于 Post on 2015-8-16 21:57:27

guo7212c 发表于 2015-8-16 11:38
自认为，MD最繁琐最漫长的就是寻找合适于自己体系的力场，没有普适的力场，只有合适的，每个人用的力场都会 ...

好的我后面看看陈老师的书。
现在看的就是刘志平老师组的博士论文跟小论文，确实挺有用的。
谢谢大侠！

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[Lammps] lammps的data文件中键角参数为0

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