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[综合交流] 平面型单体间相互作用随面间距变化相关问题求助

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                卢老师您好,我最近阅读了这篇文章:Assessing the Performance of CASPT2 and DFT Methods for the Description of Long, Multicenter Bonding in Dimers between Radical Ions[J]. Journal of chemical theory and computation. 2014, 10(2):650-8.文章中有些问题没有理解透彻,希望老师指点迷津。主要疑惑如下:
一、文章用不同的密度泛函方法来计算如下几个单体在面对面朝向下,不用距离的相互作用。但我从文章中没法得知作者是怎么调控单体间的距离,是做限制性优化,还是调控好单体的初始距离,直接做优化?如果是限制性优化,距离是怎么限制的?


原文表述为:Interaction energies are obtained from ground-state relaxed potential energy surfaces, as a function of the intermonomer distance。

TCNE 和 TTF 中调节的是C=C双键中心的距离,TCNB和TCNP调控的是环中心的距离。如为限制性优化,双键中心、环中心的距离是怎么限制的?

二、文中提到All geometries are constrained to D2h point group symmetry,怎么可以做到让二聚体的结构一直保持D2h对称性?

三、文中二聚体是由单体自由基形成的双自由基,文中用了对称性破却方法,我理解作者输入文件中的自旋多重度应该是1,这样对吗?

卢老师,我在问之前也看了您写的相关的博文,但还是一知半解,望您有时间释疑,谢谢您宝贵的时间。






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发表于 Post on 2019-3-28 02:50:58 | 只看该作者 Only view this author
1 可以用GIC实现对单体几何中心距离的柔性扫描,看
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474

2 gview里做对称化成为D2h。相关信息看
谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用
http://sobereva.com/297http://bbs.keinsci.com/thread-1355-1-1.html

3 是
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-28 14:36:03 | 只看该作者 Only view this author
谢谢卢老师

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发表于 Post on 2020-2-8 21:44:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-3-28 02:50
1 可以用GIC实现对单体几何中心距离的柔性扫描,看
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/4 ...

请问这种 自由基形成的二聚体 也可以叫 双自由基 吗?

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发表于 Post on 2020-2-9 06:09:21 | 只看该作者 Only view this author
tjuptz 发表于 2020-2-8 21:44
请问这种 自由基形成的二聚体 也可以叫 双自由基 吗?

一般不这么叫。但是电子结构上和双自由基是差不多的。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-2-9 09:20:08 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 tjuptz 于 2020-2-9 09:36 编辑
sobereva 发表于 2020-2-9 06:09
一般不这么叫。但是电子结构上和双自由基是差不多的。

谢谢老师,那如果通过设定片段分别指定电荷和自旋多重度是否属于非合理的设置啊?因为实际情况也没法提前指认

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发表于 Post on 2020-2-10 06:59:32 | 只看该作者 Only view this author
tjuptz 发表于 2020-2-9 09:20
谢谢老师,那如果通过设定片段分别指定电荷和自旋多重度是否属于非合理的设置啊?因为实际情况也没法提前 ...

那只是设置个初猜而已,只有实际存在的对应参数空间极小点的某种波函数离这个初猜比较接近,此做法才可以用于帮助收敛到这样的波函数。
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发表于 Post on 2020-2-10 10:38:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-2-10 06:59
那只是设置个初猜而已,只有实际存在的对应参数空间极小点的某种波函数离这个初猜比较接近,此做法才可以 ...

Soga 谢谢老师。

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