求助填充的溶剂分子和pbc盒子不匹配

vandenberg · 发表于 Post on 2020-3-2 14:42:21

在溶剂填充过程中，发现填充的溶剂分子和pbc盒子没有完全重合，形状都对不上，这样会对模拟结果有影响吗？
谢谢

wuzhiyi · 发表于 Post on 2020-3-2 17:57:02

没影响
用trjconv -pbc atom 来一下就知道了

vandenberg · 发表于 Post on 2020-3-3 10:09:47

wuzhiyi 发表于 2020-3-2 17:57
没影响
用trjconv -pbc atom 来一下就知道了

非常感谢

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[GROMACS] 求助填充的溶剂分子和pbc盒子不匹配