计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 23706|回复 Reply: 18
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 结合能的计算问题

[复制链接 Copy URL]

87

帖子

0

威望

376

eV
积分
463

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
想请教一下各位老师,A和B以不同的方式结合的时候,我想要看哪种结合最稳定,到底是应该看结合能的大小来判定,还是应该看A-B复合物中能量哪个更低呢?在计算的过程中发现当A和B以不同形式结合时,出现了总能量(负值)降低(更加稳定),结合能也降低的情况,所以不知该如何判断了,希望各位老师予以指导,谢谢各位老师!

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125131

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2016-11-6 13:22:47 | 只看该作者 Only view this author
讨论这个应当用A、B各自孤立存在时的结构的能量和作为参考状态。此时,复合物的能量高低和相互作用能的高低趋势必然一样。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

87

帖子

0

威望

376

eV
积分
463

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-11-7 09:17:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-11-6 13:22
讨论这个应当用A、B各自孤立存在时的结构的能量和作为参考状态。此时,复合物的能量高低和相互作用能的高低 ...

老师,意思是不是说我只要通过结合能的计算就能判定哪个结合是更加稳定的呢

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125131

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2016-11-7 15:12:41 | 只看该作者 Only view this author
sofia 发表于 2016-11-7 09:17
老师,意思是不是说我只要通过结合能的计算就能判定哪个结合是更加稳定的呢

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

87

帖子

0

威望

376

eV
积分
463

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-11-8 08:45:39 | 只看该作者 Only view this author

好的,谢谢老师!

87

帖子

0

威望

376

eV
积分
463

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-25 16:28:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-11-6 13:22
讨论这个应当用A、B各自孤立存在时的结构的能量和作为参考状态。此时,复合物的能量高低和相互作用能的高低 ...

老师,最近算了一个体系,发现当以A、B各自孤立存在时的结构的能量和作为参考状态时,复合物的能量高低和相互作用能的高低趋势也不一样,有一个复合物的相互作用能很大,但是他的A和B的总能量却相对较小,这种情况该如何分析呢?
谢谢老师!

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125131

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2017-11-25 16:56:04 | 只看该作者 Only view this author
sofia 发表于 2017-11-25 16:28
老师,最近算了一个体系,发现当以A、B各自孤立存在时的结构的能量和作为参考状态时,复合物的能量高低和 ...

那就说明变形能比较大,考察变形能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

87

帖子

0

威望

376

eV
积分
463

Level 3 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-25 17:05:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-25 16:56
那就说明变形能比较大,考察变形能

老师,那在这种情况下,我要判断哪种结构存在的比例更大(更稳定),我是根据总能量呢,还是根据结合能的大小呢?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125131

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2017-11-25 17:08:30 | 只看该作者 Only view this author
sofia 发表于 2017-11-25 17:05
老师,那在这种情况下,我要判断哪种结构存在的比例更大(更稳定),我是根据总能量呢,还是根据结合能的 ...

参考体系(即两种分子在孤立状态)都是一样的,总能量低自然结合能(已经考虑了变形能在内)就大
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

87

帖子

0

威望

376

eV
积分
463

Level 3 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-25 19:00:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 sofia 于 2017-11-25 19:01 编辑
sobereva 发表于 2017-11-25 17:08
参考体系(即两种分子在孤立状态)都是一样的,总能量低自然结合能(已经考虑了变形能在内)就大

老师,那一般计算结合能的时候应该考虑形变能才更合理吗?(看了一些文献发现在计算的时候并没有考虑形变能呢)

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125131

管理员

公社社长

11#
发表于 Post on 2017-11-26 11:33:50 | 只看该作者 Only view this author
sofia 发表于 2017-11-25 19:00
老师,那一般计算结合能的时候应该考虑形变能才更合理吗?(看了一些文献发现在计算的时候并没有考虑形变 ...


这个完全取决于你想算什么
诸如与结合过程对应的实验数据对比,那显然需要优化片段,因为此时参考状态是每个单体都在孤立状态的情况
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

87

帖子

0

威望

376

eV
积分
463

Level 3 能力者

12#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-26 15:42:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-26 11:33
这个完全取决于你想算什么
诸如与结合过程对应的实验数据对比,那显然需要优化片段,因为此时参考状态 ...

好的,谢谢老师

7

帖子

0

威望

65

eV
积分
72

Level 2 能力者

13#
发表于 Post on 2019-2-3 19:15:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-11-6 13:22
讨论这个应当用A、B各自孤立存在时的结构的能量和作为参考状态。此时,复合物的能量高低和相互作用能的高低 ...

老师,请问A,B各自孤立存在指的是孤立原子吗,还是说它们单质状态下的每个原子的能量?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125131

管理员

公社社长

14#
发表于 Post on 2019-2-4 04:57:35 | 只看该作者 Only view this author
wanidamm 发表于 2019-2-3 19:15
老师,请问A,B各自孤立存在指的是孤立原子吗,还是说它们单质状态下的每个原子的能量?

这里说的A、B是指分子
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

7

帖子

0

威望

65

eV
积分
72

Level 2 能力者

15#
发表于 Post on 2019-2-4 09:28:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-2-4 04:57
这里说的A、B是指分子

哦哦,谢谢老师回复,如果不是分子,应该怎么处理?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 05:47 , Processed in 0.190934 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list